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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002121`

染色体: Chr07 坐标: 19330697-19335266 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002121`
名称	SmilChr07G002121
描述	nucleolin 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19330697 - 19335266 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993204`
GeneID	`130993204`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993204`
原始查询	`LOC130993204`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleolin 1
产物	nucleolin 1
Arabidopsis	`AT3G18610` (NUC-L2) nucleolin like 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821392] identity=48.8; qcov=0.468; evalue=5.98e-77; confidence=medium
Rice	`Os04g0620700` (OsNUC1-S) - identity=56.5; qcov=0.374; evalue=3.5e-78; confidence=low
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993204

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057773991.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057773991.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057773991.1`
4	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.40000	`XP_057773991.1`
5	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057773991.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19331121`	`TG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B101
`Chr7:19331234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B15
`Chr7:19331432`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	A11,B33
`Chr7:19331432`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	A11,B33
`Chr7:19331455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr7:19331473`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr7:19331473`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	4	A11,B33,B68,C48
`Chr7:19331479`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B33,B68,C48
`Chr7:19331479`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B33,B68,C48
`Chr7:19331485`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A11
`Chr7:19331485`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A11
`Chr7:19331491`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773991.1

640 aa

320

640

RRM_1

PF00076 RRM_1 392-460 aa PF00076 RRM_1 509-565 aa

XP_057773992.1

639 aa

320

639

RRM_1

PF00076 RRM_1 391-459 aa PF00076 RRM_1 508-564 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773991.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	392	460	1.7e-25	89.3	RNA recognition motif
`XP_057773991.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	509	565	1.7e-25	89.3	RNA recognition motif
`XP_057773992.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	391	459	1.7e-25	89.4	RNA recognition motif
`XP_057773992.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	508	564	1.7e-25	89.4	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918009.1
ATGAAGCCCTAAAAAAGAGAAAGGAAAAACATGTAGTGAAGAAAATGAAAGCGGAGAAACACGTATCGCTGAAGCCCTATAAAAGGAGGCAGACCCCAACCCAAAAATATCTACTCCTCATTAAACCCTAATACACCTTTTAGGGTTTTTGAGAATTCCTCTCCTTCACTCGGCCGCTCTCCACATCTCTCTTCTTCAAATCTTCTGTAATGGGTAAATCCAGCAAGAAGGCAGCTAAGGTCGAAGCACCTGCTGTTGTC...

XM_057918008.1
TGAAGCCCTAAAAAAGAGAAAGGAAAAACATGTAGTGAAGAAAATGAAAGCGGAGAAACACGTATCGCTGAAGCCCTATAAAAGGAGGCAGACCCCAACCCAAAAATATCTACTCCTCATTAAACCCTAATACACCTTTTAGGGTTTTTGAGAATTCCTCTCCTTCACTCGGCCGCTCTCCACATCTCTCTTCTTCAAATCTTCTGTAATGGGTAAATCCAGCAAGAAGGCAGCTAAGGTCGAAGCACCTGCTGTTGTCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993204
ATGGGTAAATCCAGCAAGAAGGCAGCTAAGGTCGAAGCACCTGCTGTTGTCGCTACTCCGCCTTTGAAGAAAGGCAAGAGAGAAGCTGAAGAAACTATTGGGAAAAAAGTGGTGAGTGCTAAGAAGCAAAAGGTTGAAGAAAAGAAGATTGAGGCCAAGGTCGTTAAGAAGAAAGTCGAGTCATCGTCTGATGATGATTCTTCTTCAGAGTCAGAGCAACTCCCCAAGGCTAAGGCACCACCTGCCAAGAATGGTATTGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773991.1
MGKSSKKAAKVEAPAVVATPPLKKGKREAEETIGKKVVSAKKQKVEEKKIEAKVVKKKVESSSDDDSSSESEQLPKAKAPPAKNGIAHSDSEESSGLEEDAPKKAPAAAAKKNGKTTSKKKEEESSDDDSSDESSSDEDAPATKKAPPPVAKKVPEAAKKKEESSDSEDDSSSDEDVAPTKKAPAAPAKKAAKKDESSSEDESSSDEEVAATKKAPVAPAKKAAVPVAKKKDESSSEDESSSDEEVAPAKKTPAGTVAAA...

XP_057773992.1
MGKSSKKAAKVEAPAVVATPPLKKGKREAEETIGKKVVSAKKQKVEEKKIEAKVVKKKVESSSDDDSSSESEQLPKAKAPPAKNGIAHSDSEESSGLEEDAPKKAPAAAAKKNGKTTSKKKEEESSDDDSSDESSSDEDAPATKKAPPPVAKKVPEAAKKKEESSDSEDDSSSDEDVAPTKKAPAAPAKKAAKKDESSSEDESSSDEEVAATKKAPVAPAKKAAVPVAKKKDESSSEDESSSDEEVAPAKKTPAGTVAAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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