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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002122`

染色体: Chr07 坐标: 19359678-19365895 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002122`
名称	SmilChr07G002122
描述	photosystem II stability/assembly factor HCF136, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19359678 - 19365895 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993205`
GeneID	`130993205`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993205`
原始查询	`LOC130993205`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	photosystem II stability/assembly factor HCF136, chloroplastic
产物	photosystem II stability/assembly factor HCF136%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G18680` (AT1G18680) HNH endonuclease domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838449] identity=59.7; qcov=0.439; evalue=5.86e-68; confidence=low
Rice	`Os10g0335200` - identity=57; qcov=0.45; evalue=1.18e-66; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF14870 (PSII_BNR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993205

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057773993.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057773993.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057773994.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773993.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773993.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19361282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B10,B113,C41,C74
`Chr7:19362924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C2,C5,D7
`Chr7:19363832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B22,D11
`Chr7:19363832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,D11
`Chr7:19364063`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B30,B85,C79,D9
`Chr7:19364063`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B30,B85,C79,D9
`Chr7:19364077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr7:19364111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B68,C82
`Chr7:19364111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C82
`Chr7:19364766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:19364770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr7:19365169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B115,B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773993.1

401 aa

200

401

PSII_BNR

PF14870 PSII_BNR 81-399 aa

XP_057773994.1

351 aa

176

351

PSII_BNR

PF14870 PSII_BNR 81-187 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773993.1`	Pfam	`PF14870`	PSII_BNR	Repeat	81	399	1.3e-120	403.0	Photosynthesis system II assembly factor YCF48
`XP_057773994.1`	Pfam	`PF14870`	PSII_BNR	Repeat	81	187	2.3e-38	132.9	Photosynthesis system II assembly factor YCF48

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918010.1
TATTTTTAACTATTGAAAATATATATACTATTTTCTAAATTTTAACTATTGATTTTACTATTTTCTAGTAGTCAAATTGTCACAGTGTGTTAAGATACAGAGTATTTTTGTAAAATTTAATTACTAGTATATCATTACAAGTAAAATAAAATCAATCGGAGGCTTATTCCGCTGTGAGGTTAAAAAGATCCTACGCACATGTCAACGTTTCTAAGCTTTTAATAGTAAGTAGACATTTAGGATATACTTTAATTATTTAA...

XM_057918011.1
TAGTTTAGTTAAGGGGGAGACAGGCAACCGTTGGATGAGATATTGCCAACCGCAATTTGAAATTCCTTCGGATAAGACGCAGCACAACCCAACTGCGCGCAATCTAGAGAGAGAGAATAGACACATCATCGCCTTCACCACCCACACGCTCAACCATGGCGGCTCTTCAGCACCTGTCCTCCTCTATTATCGCTCCCCTGCCGTCGCAGCTCCGCTCTCGTTTCAATCTCCGCCGCCGCTGCTGCCGCCTCCTCCCTTCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993205
ATGGCGGCTCTTCAGCACCTGTCCTCCTCTATTATCGCTCCCCTGCCGTCGCAGCTCCGCTCTCGTTTCAATCTCCGCCGCCGCTGCTGCCGCCTCCTCCCTTCCGCCTCCGCCGCTCCTCACCCCGACCAAACTGATAATGCTATTACCCGCCGTCAATTGATAGGTGGACTCCAAGCAGCAGCCGCATTTTCGCTCTCTCCGCTCGGCCGCAAGGCGTTGGCCGCGGAGGACCCGCTGTCCGAGTGGGAGAGAGTTTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773993.1
MAALQHLSSSIIAPLPSQLRSRFNLRRRCCRLLPSASAAPHPDQTDNAITRRQLIGGLQAAAAFSLSPLGRKALAAEDPLSEWERVFLPIDPGVVLLDIAFVPDDPSHGFLLGTRQTLLETKDGGSTWAPRSIPSAEDEDFNYRFNCISFKGKEGWIIGKPAILLYTPDAGDTWKRIPLSSQLPGDMVYIKASGEKGAELVTDQGAIYVTSNGGYNWKAAIQETVSATLNRTVSSGISGASYYTGTFSTVNRSPEGKYVA...

XP_057773994.1
MAALQHLSSSIIAPLPSQLRSRFNLRRRCCRLLPSASAAPHPDQTDNAITRRQLIGGLQAAAAFSLSPLGRKALAAEDPLSEWERVFLPIDPGVVLLDIAFVPDDPSHGFLLGTRQTLLETKDGGSTWAPRSIPSAEDEDFNYRFNCISFKGKEGWIIGKPAILLYTPDAGDTWKRIPLSSQLPGDMHHWVRYSRSSNKEERPRFFDSKAKKICWDNAKKFPGRDPERWRIDAAGNIVCKRLHTCNGCLCYEYDHIIPFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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