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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002123`

染色体: Chr07 坐标: 19366290-19370566 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002123`
名称	SmilChr07G002123
描述	uncharacterized SmilChr07G002123
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19366290 - 19370566 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993206`
GeneID	`130993206`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993206`
原始查询	`LOC130993206`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Peptidoglycan-binding LysM domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832377]; symbol=AT5G23130; hit=AT5G23130; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Peptidoglycan-binding LysM domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832377]; symbol=AT5G23130; hit=AT5G23130; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G23130` (AT5G23130) Peptidoglycan-binding LysM domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832377] identity=40.5; qcov=1.24; evalue=5.42e-68; confidence=medium
Rice	`Os10g0485500` - identity=37.7; qcov=1.1; evalue=8.06e-40; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01476 (LysM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993206

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057773996.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057773996.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057773996.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057773996.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057773996.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19366676`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr7:19366784`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B134
`Chr7:19366784`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B134
`Chr7:19366861`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A16,A19,B130,B131,B41,B6,B63,B65,B73,B78,B91,C47,C56,C63
`Chr7:19366866`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A16,A19,B124,B131,B41,B6,B63,B65,B73,B78,B91,C47,C56,C63
`Chr7:19366870`	`G`	`GAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	14	A16,A19,B124,B131,B41,B6,B63,B65,B73,B78,B91,C47,C56,C63
`Chr7:19366903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B63,B65
`Chr7:19366922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C3
`Chr7:19367258`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C14,C73,D3
`Chr7:19367264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C3
`Chr7:19367399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B122,B34,B45
`Chr7:19369982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B20,B93,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057773996.1

372 aa

186

372

LysM

PF01476 LysM 56-97 aa

XP_057773997.1

325 aa

162

325

LysM

PF01476 LysM 56-97 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057773996.1`	Pfam	`PF01476`	LysM	Domain	56	97	0.00012	22.7	LysM domain
`XP_057773997.1`	Pfam	`PF01476`	LysM	Domain	56	97	9.7e-05	23.0	LysM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918014.1
CTATACATGAATTGTTGTTGATTACTCCTTTTGTTTTGTTTTTCTACTGCATTGTACCTCTTATGAAAATCTGGTTGTTGCTGTTTTTATTATTATTATTATTATTTGATGAAATCTGATTTTCGTTATAATAAATGAATTGAAAATAAAAACCAACTTAACATTTCAGTAATTACCAACTAAAAGAAAAAACATTTTGGTAATTACTTTTAAAATTACTGCAAAGCACATATAAAAGGGCAGAATTTTGCAGTCGATTA...

XM_057918013.1
TCTACTGCATTGTACCTCTTATGAAAATCTGGTTGTTGCTGTTTTTATTATTATTATTATTATTTGATGAAATCTGATTTTCGTTATAATAAATGAATTGAAAATAAAAACCAACTTAACATTTCAGTAATTACCAACTAAAAGAAAAAACATTTTGGTAATTACTTTTAAAATTACTGCAAAGCACATATAAAAGGGCAGAATTTTGCAGTCGATTAGCAGATGCCAATTAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAATCCCTCCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993206
ATGGAAAGATACAGGATATTGGATTATGATAATGGCGAAGTGGAATTTGAATCCAGATTAATGGTGGGATCATCATCGCCCTCGAGATCACTGCCGATTTCGACGCCGCCGTCCGATGCCGCCGGTGTAGGCCTAAACGGTGGGCATAATTACATAATACACCCCGTTGGCAAATACGACACCCTCGCCGGCGTTGCCATAAAATATGGTGTCGAGGTGGCAGATATTAAGAGGTTAAATGGATTGGTGACTGATCTCCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057773996.1
MERYRILDYDNGEVEFESRLMVGSSSPSRSLPISTPPSDAAGVGLNGGHNYIIHPVGKYDTLAGVAIKYGVEVADIKRLNGLVTDLQMFALKTLKIPLPGKHPPSPTLCNGQETQRPSSSEQDPSNRQHSDLFDSFQSLKLCSSSEHKVSPAMNSLQGYYGLRQPDQKATSGDQNGKAKYLEDGSFYTPSKHPLSHQRKSRSVANNLMYANGGLHDPLLSPESEDGGTNKWIEKLLGRRQKSETELTSCPPEKLLKEESS...

XP_057773997.1
MERYRILDYDNGEVEFESRLMVGSSSPSRSLPISTPPSDAAGVGLNGGHNYIIHPVGKYDTLAGVAIKYGVEVADIKRLNGLVTDLQMFALKTLKIPLPGKHPPSPTLCNGQETQRQPDQKATSGDQNGKAKYLEDGSFYTPSKHPLSHQRKSRSVANNLMYANGGLHDPLLSPESEDGGTNKWIEKLLGRRQKSETELTSCPPEKLLKEESSSSSGISSGGLALRSKAATRAFSSGVDAESGGLNPIPLNLGESPQTDP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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