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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002131`

染色体: Chr07 坐标: 19479097-19485668 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002131`
名称	SmilChr07G002131
描述	uncharacterized SmilChr07G002131
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19479097 - 19485668 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993213`
GeneID	`130993213`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993213`
原始查询	`LOC130993213`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RPA1A; symbol=RPA1A; hit=Os02g0776800; species=rice; confidence=low
产物	RPA1A; symbol=RPA1A; hit=Os02g0776800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G45400` (RPA70C) Replication factor-A protein 1-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834576] identity=25.8; qcov=1; evalue=5.67e-06; confidence=low
Rice	`Os02g0776800` (RPA1A) - identity=25.8; qcov=1; evalue=1.25e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF16900 (REPA_OB_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993213

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774004.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057774004.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774004.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774004.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774004.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19479201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B138,B31,C42,D8
`Chr7:19479429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr7:19480308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B49,C64,C71
`Chr7:19480314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B18
`Chr7:19480318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B18,B48
`Chr7:19480329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B76
`Chr7:19480348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:19480361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B11,B61,B69,C75
`Chr7:19480399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B82
`Chr7:19480414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	63	A11,A13,A21,A23,A5,A6,B100,B105,B109,B113,B114,B115,B118,B12,B122,B124,B125,B131,B133,B2,B20,B23,B25,B26,B40,B47,B48,B52,B53,B57,B62,B71,B78,B84,B94,B99,C14,C22,C23,C26,C28,C34,C4,C47,C5,C51,C54,C56,C57,C60,C61,C64,C65,C66,C7,C79,C80,C81,C83,C85,D2,D3,D4
`Chr7:19480439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,B32
`Chr7:19480568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A25,B140,B44,B95,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774004.1

228 aa

114

228

REPA_OB_2

PF16900 REPA_OB_2 34-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774004.1`	Pfam	`PF16900`	REPA_OB_2	Domain	34	126	2.1e-08	34.7	Replication protein A OB domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918021.1
GGTCGACCACTTGTATATGCTTGGCTTCGGCCTTGCCACCCAAATTGAGCAACTGGATGAAGGCTTCGAAATTCTGGAAAATGGATTTAATTTTATTCCCTTTACAGATATTCCTACACACGATCCCACTTTCTTTTTGGATGTTCTTGGGGAGGTTATGACCCACACTATTAACATAGTTAAAGTCGAAATCAGAACTGGCAAGGCATCCAAGTGTGACATAACATTAGCCGATGCAGACGGCACGCAAGTAACCTGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993213
ATGCTTGGCTTCGGCCTTGCCACCCAAATTGAGCAACTGGATGAAGGCTTCGAAATTCTGGAAAATGGATTTAATTTTATTCCCTTTACAGATATTCCTACACACGATCCCACTTTCTTTTTGGATGTTCTTGGGGAGGTTATGACCCACACTATTAACATAGTTAAAGTCGAAATCAGAACTGGCAAGGCATCCAAGTGTGACATAACATTAGCCGATGCAGACGGCACGCAAGTAACCTGTGTCTTATGGGGATCACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774004.1
MLGFGLATQIEQLDEGFEILENGFNFIPFTDIPTHDPTFFLDVLGEVMTHTINIVKVEIRTGKASKCDITLADADGTQVTCVLWGSLAEELKTFMENKSAEDKEPVMVALQFAKISTFRGQIKVSSMKNPSNFFICPDIKEVKDFILRRGVSRSSSCNDTITDISIGQQALNRNEWLDAAHARRLCDLIKSEECGTFNCKGTILNFHPQESWYYEACGNDRCLKGIAR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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