当前解析结果
SmilChr07G002133| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002133 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002133 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002133 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 19486862 - 19488835 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130993215 |
|---|---|
| GeneID | 130993215 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993215 |
| 原始查询 | LOC130993215 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993215 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057774006.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057774006.1 |
| 3 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057774006.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057774006.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057774006.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:19487565 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B139 |
Chr7:19487701 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B79,C43 |
Chr7:19487763 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B28 |
Chr7:19488323 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C9 |
Chr7:19488342 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B139 |
Chr7:19488377 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | A1,B124,B140,B17,B64,B79,C52,D3 |
Chr7:19488383 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B26,B64,C37 |
Chr7:19488391 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B119,B40,C10 |
Chr7:19488413 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B103,C12,C57 |
Chr7:19488442 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B52,C29 |
Chr7:19488447 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A22,C48 |
Chr7:19488473 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B104,B5,C23,C27 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。