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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002135`

染色体: Chr07 坐标: 19501836-19506665 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002135`
名称	SmilChr07G002135
描述	tobamovirus multiplication protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19501836 - 19506665 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993216`
GeneID	`130993216`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993216`
原始查询	`LOC130993216`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tobamovirus multiplication protein 3-like
产物	tobamovirus multiplication protein 3-like
Arabidopsis	`AT2G02180` (TOM3) tobamovirus multiplication protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814749] identity=81; qcov=0.958; evalue=2.28e-171; confidence=high
Rice	`Os10g0537500` (OSJNBa0040D23.4) - identity=80.3; qcov=0.941; evalue=8.66e-166; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06454 (THH1_TOM1-3_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993216

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057774007.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.20000	`XP_057774007.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057774007.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057774007.1`
5	Lysosome	溶酶体	0.20000	`XP_057774007.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19501994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr7:19502014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B47
`Chr7:19502017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,D5
`Chr7:19502684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B44,B70,C40,C55
`Chr7:19502823`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr7:19502856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,C15,C21
`Chr7:19502874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B44,C6
`Chr7:19503408`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr7:19503423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:19503553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr7:19504212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:19505508`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,C14,C23,C73,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774007.1

286 aa

143

286

THH1_TOM1-3_dom

PF06454 THH1_TOM1-3_dom 16-286 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774007.1`	Pfam	`PF06454`	THH1_TOM1-3_dom	Domain	16	286	1.7e-144	481.0	THH1/TOM1/TOM3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918024.1
GGACCCATGAAGGTGAAAACTCCACGTGGGCAGTCTTGGTGGAGAGTGAGATGCGATTCAGTTTGTTTCTTCCACCACCATTGTCATCTTCTCTTCCATGTCTGACAATCCCACCTCAACACTAACGTACACTACCTGATATGTTGGGCCGATCGACGGCGCTCGCTCTTCTCTTCAAGGACGCCGTCACCTGGTGGGACACCGTCAATAGGTCCCCCATTTGGCAGGATCGGATTTTCCACGTCCTCGCCGCTCTCTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993216
ATGTTGGGCCGATCGACGGCGCTCGCTCTTCTCTTCAAGGACGCCGTCACCTGGTGGGACACCGTCAATAGGTCCCCCATTTGGCAGGATCGGATTTTCCACGTCCTCGCCGCTCTCTATGGACTGGTCACCGTTGTTGCTCTTGTACAATTGGTAAGGATACAATTGAGAGTACCAGAGTATGGTTGGACTACACAGAAAGTATTCCACTTCCTCAATTTCTTGGTTAACGCAGTTCGATGCTTAGTATTTATATTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774007.1
MLGRSTALALLFKDAVTWWDTVNRSPIWQDRIFHVLAALYGLVTVVALVQLVRIQLRVPEYGWTTQKVFHFLNFLVNAVRCLVFIFRRDIQDLEPEIVQHVMLDLPSLAFFTTYALLVLFWAEIYYQARAVSTDWLRPTFYTINGVVYAIQIVLWLVLWWKPLHVTIVLSRMFFAGVSLFAALGFLLYGGRLFLMLQRFPVESKGRRKKLQEVGYVTTICFSCFLIRSIMMCFNALQTAADLDVLDHPVLNFIYYFLVEI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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