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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002160`

染色体: Chr07 坐标: 19750239-19760642 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002160`
名称	SmilChr07G002160
描述	protein SHORT ROOT IN SALT MEDIUM 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19750239 - 19760642 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993222`
GeneID	`130993222`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993222`
原始查询	`LOC130993222`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SHORT ROOT IN SALT MEDIUM 1
产物	protein SHORT ROOT IN SALT MEDIUM 1
Arabidopsis	`AT2G03150` (emb1579) ATP/GTP-binding protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814844] identity=54.2; qcov=0.208; evalue=3.67e-97; confidence=weak
Rice	`Os06g0562700` - identity=44.6; qcov=0.286; evalue=3.86e-26; confidence=weak
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0030374 (GO:0030374)
KEGG	-
Pfam	PF14443 (DBC1); PF19256 (LAIKA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993222

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774015.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057774015.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057774015.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774015.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774015.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19750563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B108,B35
`Chr7:19751699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,C7,C76
`Chr7:19751726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C44
`Chr7:19751744`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr7:19751775`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C48
`Chr7:19751816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,C7,C76
`Chr7:19752423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr7:19752481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B8,C29
`Chr7:19752684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr7:19752771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr7:19752814`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C44
`Chr7:19752817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774015.1

1372 aa

686

1372

DBC1

LAIKA

PF14443 DBC1 578-695 aa PF19256 LAIKA 1067-1129 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774015.1`	Pfam	`PF14443`	DBC1	Domain	578	695	2e-41	141.6	DBC1
`XP_057774015.1`	Pfam	`PF19256`	LAIKA	Domain	1067	1129	3.7e-20	72.2	LAIKA domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918032.1
GTAACAGTTTTGACAAAGCCCTCTTTGAAAAATCCCCCAAATATAAATATGTATCCACATGCGCAGGCCGCTCACTAGGGCTCTGCCACTTTTACTCATTCTTTACCCTTTTCATTTGTTCGGCACTCCTCCGACATTAGTTAGGCCGCCGGCCACCGCCGTCTCCGGCTTCAGATTCGCCGATTGTTTTAATTCAGTCAAGACTGATTTTCGCCTCGCATGTTCGCCGCTGTCTGAATTATTTTTCCCGTAATTGGTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993222
ATGTATTCTCGAGGGAACAATCCCTACGGCCAACAGCAACCCTACTCATCACAATCTTCGTACGCCGCTCAAAACTTGGGTGCTTCAGCAATTCTAGGAGGGCGTCCGCAAGAATCGGAATTTGGTGGGCTCAGGGCTCATGGTCATGTACAGGGGCATCCCTCGGCCACTGCGGCTGTTGCAGGGTCGCCGCAGCAGCCACATTATGGTGGGCAGTACAATTCGGTCTATGGTTCTGCGGCGCAGCAGATTTCTCCAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774015.1
MYSRGNNPYGQQQPYSSQSSYAAQNLGASAILGGRPQESEFGGLRAHGHVQGHPSATAAVAGSPQQPHYGGQYNSVYGSAAQQISPMGKGSVGPALESRGNYGSSIPDSPKFGTDYVPSSSRGYGQKVDQFLSEYPSIERRQYAAERHSAYLGTDLPSETLSRYVDPVSFGNEHQSKMYDHVEQATMLRQEQVLKARGLQSASVEGGTRQADYLAARATVRHPGQDPISYGGRIDPESRDFSMASSYGGQQTASILGAAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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