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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002141`

染色体: Chr07 坐标: 19582786-19586814 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002141`
名称	SmilChr07G002141
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 17-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19582786 - 19586814 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993227`
GeneID	`130993227`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993227`
原始查询	`LOC130993227`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 17-like
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 17-like
Arabidopsis	`AT2G02160` (AT2G02160) CCCH-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814747] identity=40; qcov=0.826; evalue=1.15e-96; confidence=medium
Rice	`Os04g0671800` (OsC3H32) - identity=30.4; qcov=1.11; evalue=5.29e-56; confidence=low
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF14608 (zf-CCCH_2); PF15663 (zf-CCCH_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993227

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774021.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774021.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774021.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774021.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774021.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19583083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B107,B5,B62,C60
`Chr7:19584143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr7:19584732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B138,B31,C42,D8
`Chr7:19584746`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,B31
`Chr7:19584955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,C52,C7,C76
`Chr7:19584993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C46,C83
`Chr7:19585184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr7:19585421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:19585621`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B107,B5,B62,C60
`Chr7:19585690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:19585781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:19585809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B107,B72,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774021.1

684 aa

342

684

zf-CCCH_3

zf-CCCH_2

PF15663 zf-CCCH_3 28-82 aa PF14608 zf-CCCH_2 32-53 aa PF14608 zf-CCCH_2 63-82 aa PF14608 zf-CCCH_2 123-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774021.1`	Pfam	`PF15663`	zf-CCCH_3	Family	28	82	1.1e-15	58.4	Zinc-finger containing family
`XP_057774021.1`	Pfam	`PF14608`	zf-CCCH_2	Domain	32	53	8.8e-09	36.3	RNA-binding, Nab2-type zinc finger
`XP_057774021.1`	Pfam	`PF14608`	zf-CCCH_2	Domain	63	82	8.8e-09	36.3	RNA-binding, Nab2-type zinc finger
`XP_057774021.1`	Pfam	`PF14608`	zf-CCCH_2	Domain	123	142	8.8e-09	36.3	RNA-binding, Nab2-type zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918038.1
TGATCAATCATCGCCTTCAAATCCCAAACCCCAAATTAAAAAAATGGAAAAGAAGAAGGGGAGAAAGGGGATCTCCATCTCCCCTACACAACACGCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCATCATAGTCCATTATCGTTCCCATTAGGGTGGCTGTATGTATCTGTTGCAGCTTTAAAAGAAGAAGATAGCGACCCTGCATGAGATTATCCGCCTCAACAATTAAACCCTAGATCCCTCTCTCTCTCTCTCTTCCTCCCTTTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993227
ATGATTACTGGGGAGCTTGAGGGTGGGAGACTGGCGGGAGCTGCCGCACCTCAACCTCCTTCTGCCGAAGAAGAAGCGCTCAAGAAGAACACCGATTGTGTTTACTTTCTCGCTTCTCCTTTAACCTGCAAAAAGGGAAGTGAGTGTGAGTACCGACACAGTGACTTTGCCAGGGTAAATCCAAGGGACTGTTGGTTCTGGTTAAATGGCAACTGCTTGAATCCAAAGTGCGGATTTCGACATCCGCCACTTGATGGGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774021.1
MITGELEGGRLAGAAAPQPPSAEEEALKKNTDCVYFLASPLTCKKGSECEYRHSDFARVNPRDCWFWLNGNCLNPKCGFRHPPLDGLIGTQLPTPTGSAQPLLQTVAMTPVQVGDANSIQGVPCKFFQSGLCLKGDWCSFTHVPNSMRNKASVVPVTASATEPSNLSKVDISMLGKKIPPPTNKGKPIKGPVDQQVAEIVVKPGVHINELSRNKRIPDTSCINELLDYSHPVSNGDMVNRFISVKQPHQVDDPGMIDNKN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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