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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002143`

染色体: Chr07 坐标: 19597928-19599830 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002143`
名称	SmilChr07G002143
描述	uncharacterized SmilChr07G002143
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19597928 - 19599830 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993233`
GeneID	`130993233`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993233`
原始查询	`LOC130993233`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	E3 ubiquitin-protein ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821537]; symbol=AT3G19990; hit=AT3G19990; species=arabidopsis; confidence=high
产物	E3 ubiquitin-protein ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821537]; symbol=AT3G19990; hit=AT3G19990; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G19990` (AT3G19990) E3 ubiquitin-protein ligase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821537] identity=63.7; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0828200` - identity=61.2; qcov=0.969; evalue=1.18e-178; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF20680 (DUF6817)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993233

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057774035.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.40000	`XP_057774035.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057774035.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057774035.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774035.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19598530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,D8
`Chr7:19598578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:19598588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:19598665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B138,B25,B31,C59
`Chr7:19598705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B117
`Chr7:19598740`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B100,B107
`Chr7:19598740`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B100,B107
`Chr7:19598792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C86
`Chr7:19598943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B122,B2,B81,C53
`Chr7:19599062`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr7:19599146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C2
`Chr7:19599219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774035.1

423 aa

212

423

DUF6817

PF20680 DUF6817 42-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774035.1`	Pfam	`PF20680`	DUF6817	Domain	42	128	4.2e-30	104.4	Domain of unknown function (DUF6817)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918052.1
AATACCAAGAAATGAGGGAGATGAAGGTATTGTTTGTGCAAATGAGTGAGAAGATGAATAAGAAGGTGGCAACGAGCGAAAGAGGTTGGAATAACAAATTCCTAGTCCAAACATGAAGTAGCACGCATTGATGGATGGTATAGATGTTGAATGGATGCAGCATTCTTTACACAAGATGCAAATGGTGAGTTTGCTGGTCACATGGGCTGGTCTTCTAAGTCTTAATAAGACTTAGCAAGCTGGAACTCGTTAGTCAATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993233
ATGGCGCCATCTTCCAACACTCTACAACACGACCACAGCCTCCAACCACTGCTCCAATCAGCCCGCCCTTTCCTGCGCGGCGAGCTCCATCACGTCGACCAACACCTACCGCGCCTCGTCTCCGTGCTTCAGGCCACCGGCGCCGGCGAGTGCTGGCACAAGCACGGCAGCTTCCTCGACCACCTCATCGGCGTCTACCGCATCCTCAAGCTTTGGAACGCCCCCGACGCCGTCTGCCTCTGCGGCCTCTTCCACTCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774035.1
MAPSSNTLQHDHSLQPLLQSARPFLRGELHHVDQHLPRLVSVLQATGAGECWHKHGSFLDHLIGVYRILKLWNAPDAVCLCGLFHSAYSNSYVNLAIFPPSSTGRDTVRGHVGSAAERLIHLFCIVPRQPLIHDLLLFKYTDAELVDHLRSSEIALQKFRGGGELGEDESWRAKLQSICPAEGINVKHIKTGEDLLISRRLVAIFLLMTIADFSDQLFSFQDTLFDNHDGRLEFVGNNTLTSLWPGDGKPGLWMSSASRM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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