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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003387`

染色体: Chr01 坐标: 52546295-52547011 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003387`
名称	SmilChr01G003387
描述	protein MKS1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	52546295 - 52547011 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993237`
GeneID	`130993237`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993237`
原始查询	`LOC130993237`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein MKS1-like
产物	protein MKS1-like
Arabidopsis	`AT3G18690` (MKS1) MAP kinase substrate 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821400] identity=43; qcov=0.605; evalue=2.27e-11; confidence=low
Rice	`Os08g0102900` (OsVQ32) - identity=46; qcov=0.418; evalue=1.68e-11; confidence=low
GO	GO:0005634 (nucleus)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05678 (VQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993237

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774042.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057774042.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774042.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774042.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774042.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:52546569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,A6,B28,C38,C75
`Chr1:52546620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,C26
`Chr1:52546626`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr1:52546696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr1:52546713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774042.1

177 aa

177

PF05678 VQ 66-93 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774042.1`	Pfam	`PF05678`	VQ	Motif	66	93	1.9e-11	43.9	VQ motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918059.1
CCCATCATTTTTCCAAAACTCTCGTTTCCGGCTCCAACCCCACACCAATCTCCGCCGTCGCCGCCGCCATGTCCGACGCCCCTTTGCGCCACTTCCCACGGCAGGAGCTCCACCTAGGTGGCCCCCGCCCGCCGCCGCTAAGCTTAAGTAAACAATCCCGCAAGATAAGCAAACAAAAGGCTGCGCCACCGCCGCCGCCAGCAGCAGCCGCAGAACCTAAATCTCACCGCCGCCACCCTCCGCCGCCGCCCGTCATAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993237
ATGTCCGACGCCCCTTTGCGCCACTTCCCACGGCAGGAGCTCCACCTAGGTGGCCCCCGCCCGCCGCCGCTAAGCTTAAGTAAACAATCCCGCAAGATAAGCAAACAAAAGGCTGCGCCACCGCCGCCGCCAGCAGCAGCCGCAGAACCTAAATCTCACCGCCGCCACCCTCCGCCGCCGCCCGTCATAATCTACACCGTCTCTCCCAAGAAAATCCACGTCGACCCTAGCGAGTTCATGACCATCGTCCAACGTTTGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774042.1
MSDAPLRHFPRQELHLGGPRPPPLSLSKQSRKISKQKAAPPPPPAAAAEPKSHRRHPPPPPVIIYTVSPKKIHVDPSEFMTIVQRLTGNTPPPPSSSALRENGGGVFPAAQPVSNTQFSDGCVETSQNLLWNATDNTHLMNTGLHGNINQNNLLENNLMMNMPSSSGFDAFNYLFDI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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