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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002159`

染色体: Chr07 坐标: 19736589-19740138 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002159`
名称	SmilChr07G002159
描述	uncharacterized SmilChr07G002159
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19736589 - 19740138 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993239`
GeneID	`130993239`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993239`
原始查询	`LOC130993239`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribosomal RNA small subunit methyltransferase J [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830754]; symbol=AT5G08540; hit=AT5G08540; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ribosomal RNA small subunit methyltransferase J [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830754]; symbol=AT5G08540; hit=AT5G08540; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G08540` (AT5G08540) ribosomal RNA small subunit methyltransferase J [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830754] identity=63.5; qcov=0.893; evalue=5.45e-128; confidence=high
Rice	`Os04g0527800` - identity=61.5; qcov=0.816; evalue=1.02e-125; confidence=high
GO	GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0009941 (chloroplast envelope)
KEGG	-
Pfam	PF22915 (ARMH5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993239

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057774043.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057774043.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057774043.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.40000	`XP_057774043.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774043.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19736885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C44
`Chr7:19737142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr7:19737450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B73,C7
`Chr7:19737875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr7:19737965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C6,C86
`Chr7:19739697`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr7:19739827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B115,B124,B140,B20
`Chr7:19739832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr7:19739912`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B8,C29,C63,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774043.1

347 aa

174

347

ARMH5

PF22915 ARMH5 195-286 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774043.1`	Pfam	`PF22915`	ARMH5	Domain	195	286	2.3e-40	137.7	Armadillo-like helical domain-containing protein 5

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918060.1
AGTATATAGTTTGTTTTGATTGTAAATACACGCACGGATAGTTTTGCTAATTCTAGAAGTTATAACCCTCACCTCCTTAGACGGCACACTGCGCCGATTCAAGTCCGGCCTTCGCCGGCATTCTCCTCCTCCTTCCGCCGCTACTCACCGTTGAACTCCGACATAATCCAATACCCCTTTTATCTCCGCTCAACATGACAACTTGCAATGGCAGCTTCTACACTAGCTCTAGCTCTTCCCACACTTCCATCGACGCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993239
ATGACAACTTGCAATGGCAGCTTCTACACTAGCTCTAGCTCTTCCCACACTTCCATCGACGCCGCCATTCCCCTCTTCCCGAAATCCTTATCTTTAATTCCCAAACGCAAACCCTTCGCTCCTCAATTCGGCCCCACACTTCCACTGCTGACGGTATCTTCTGCACCTTCTCGCCCGATATTAGTAAAAGCGGCTGCTAGTAGTGGCAAAAGCAGCAATCTCGATACCAAGAAGGAAGTAGAGGTGGCTGAGGAGGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774043.1
MTTCNGSFYTSSSSSHTSIDAAIPLFPKSLSLIPKRKPFAPQFGPTLPLLTVSSAPSRPILVKAAASSGKSSNLDTKKEVEVAEEEEEEVEEELPWIQEKALDLVEFTGSVTQTIPGPRVGQSSLPWILAVPLAYLGITFVVAVVKTVRKFNSPREKRRKLVNKNAMLCISLDELFEKGMSEVNQSALKELMQKTGFDMKEILRKYIRYVLNEKPFNPDLIANLIHLRKETQLEDSEVAGILNEISGRIVNDKGPVVMDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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