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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002167`

染色体: Chr07 坐标: 19842915-19844461 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002167`
名称	SmilChr07G002167
描述	D-galacturonate reductase-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19842915 - 19844461 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993240`
GeneID	`130993240`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993240`
原始查询	`LOC130993240`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	D-galacturonate reductase-like
产物	D-galacturonate reductase-like
Arabidopsis	`AT1G59960` (AT1G59960) NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842290] identity=49.2; qcov=0.956; evalue=6.05e-102; confidence=high
Rice	`Os10g0114300` (OSJNBa0092N12.13) - identity=60.3; qcov=0.911; evalue=1.29e-117; confidence=high
GO	GO:0004032 (aldose reductase (NADPH) activity); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	smil00053 (Ascorbate and aldarate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00248 (Aldo_ket_red)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993240

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057774044.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057774044.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774044.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774044.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774044.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19843072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:19843346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B101,B75
`Chr7:19843600`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	41	A2,A25,B102,B105,B110,B113,B114,B120,B124,B131,B134,B16,B22,B23,B28,B29,B31,B34,B38,B45,B47,B49,B64,B74,B78,B9,B98,C10,C15,C26,C28,C48,C59,C61,C63,C67,C72,C79,C83,C84,C9
`Chr7:19843831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr7:19843933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B2,B24,C82
`Chr7:19844058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:19844070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr7:19844093`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,A18,B117,B67,C39
`Chr7:19844106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr7:19844146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C73,C86
`Chr7:19844156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B2,B24,C82
`Chr7:19844172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,C73,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774044.1

315 aa

158

315

Aldo_ket_red

PF00248 Aldo_ket_red 19-289 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774044.1`	Pfam	`PF00248`	Aldo_ket_red	Domain	19	289	4.3e-56	190.9	Aldo/keto reductase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918061.1
TTTCGTGTAATGTAAACAAAAGAAATTTAAGCAGACTTAGAAGTTTCCATTGAGTAGGTTTAATGAAAAAAAGAAAGTGATTAATGATTATGAAAGTCCGGCCTTTGTAGACATTCATTTCGTATTTTCGTCGGCATTCTCTTTGTCTCTGCCTACAAATACTGCACTGCCCGCCACAAACACATGCATCAAAAATCTCTCTCACCATCAGTTGCAGAGAGGAATCAAATTCTAAGATGGCAGTGATCCCGTCGTTGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993240
ATGGCAGTGATCCCGTCGTTGAAGCTCCGCGGCGTCGACAAGCCGATGCCGCTGATCGGCATGGGAACGGCGTCGTTCCCGCCGGCCGACCTGGAGACGACCAAGGCGGCCGTGCTGGAGGCCATCAAGGCCGGCTACCGCCACTTCGACACGGCGTTCGCCTACGGCTCCGAGAAGGCGCTGGGCGAGGCCGTCGCCGAGGCCCTGCGCCTCGGCCTCGTGCAGTCGCGCGACGATCTCTTCATCACCACCAAGCTGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774044.1
MAVIPSLKLRGVDKPMPLIGMGTASFPPADLETTKAAVLEAIKAGYRHFDTAFAYGSEKALGEAVAEALRLGLVQSRDDLFITTKLWVSFTEPSKVVAACEMSLQNLQLEYVDMYLIHWPVTLTEMVRPPVPAEMVKALDMRGVWERMEECKNLGLVKGIGVSNFSCKHLEQLLSIAKIPPALNQVEMNPFWQQKKLRDFCKEKGIHVTAYSPLGANNTKWGDNRILGNDVLADIAKPIGKTTAQVALRWLYEQGVSIAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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