当前解析结果
SmilChr07G002171| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002171 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002171 |
| 描述 | cyclin-J18-like |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 19894156 - 19900177 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130993243 |
|---|---|
| GeneID | 130993243 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993243 |
| 原始查询 | LOC130993243 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cyclin-J18-like |
| 产物 | cyclin-J18-like |
| Arabidopsis | AT2G01905 (CYCJ18)cyclin J18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768365] identity=58.1; qcov=0.947; evalue=8.7e-77; confidence=high |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00134 (Cyclin_N) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993243 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057774048.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057774050.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057774048.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057774048.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057774048.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057774048.1PF00134
Cyclin_N 9-126 aa
XP_057774049.1PF00134
Cyclin_N 9-109 aa
XP_057774050.1PF00134
Cyclin_N 9-126 aa
XP_057774051.1PF00134
Cyclin_N 9-109 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057774048.1 |
Pfam | PF00134 |
Cyclin_N | Domain | 9 | 126 | 2.2e-08 | 34.6 | Cyclin, N-terminal domain |
XP_057774049.1 |
Pfam | PF00134 |
Cyclin_N | Domain | 9 | 109 | 6.1e-06 | 26.7 | Cyclin, N-terminal domain |
XP_057774050.1 |
Pfam | PF00134 |
Cyclin_N | Domain | 9 | 126 | 1.8e-08 | 34.8 | Cyclin, N-terminal domain |
XP_057774051.1 |
Pfam | PF00134 |
Cyclin_N | Domain | 9 | 109 | 5.2e-06 | 26.9 | Cyclin, N-terminal domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。