Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000903`

染色体: Chr01 坐标: 19085731-19086400 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000903`
名称	SmilChr01G000903
描述	uncharacterized SmilChr01G000903
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	19085731 - 19086400 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993257`
GeneID	`130993257`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993257`
原始查询	`LOC130993257`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993257

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774101.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774101.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774101.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774101.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774101.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:19085781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,A3,A4,B132,C23
`Chr1:19085796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	126	A11,A14,A15,A16,A25,A3,A4,A5,A6,A7,B101,B102,B104,B106,B107,B108,B111,B112,B113,B117,B121,B122,B123,B125,B126,B127,B128,B13,B131,B132,B133,B135,B139,B14,B140,B16,B17,B19,B20,B21,B23,B24,B25,B28,B29,B30,B31,B37,B39,B42,B43,B44,B48,B53,B54,B56,B57,B58,B60,B63,B65,B66,B69,B71,B72,B74,B75,B77,B78,B79,B84,B88,B9,B90,B93,B94,B95,C11,C15,C17,C19,C2,C21,C23,C24,C25,C26,C28,C31,C33,C34,C40,C43,C44,C45,C49,C5,C51,C54,C56,C58,C59,C61,C63,C64,C65,C66,C68,C69,C72,C74,C75,C76,C77,C79,C8,C81,C83,C85,C86,D1,D2,D3,D5,D6,D9
`Chr1:19085837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B119,B132,C23,C31
`Chr1:19085864`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	33	A1,A13,A14,A16,B101,B108,B109,B113,B124,B128,B136,B17,B31,B34,B52,B7,B79,B80,B89,B9,B91,B93,C17,C2,C20,C38,C46,C55,C76,C78,C82,C83,D11
`Chr1:19085867`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	34	A1,A13,A14,A16,B101,B108,B109,B113,B124,B128,B136,B17,B31,B34,B52,B7,B79,B80,B89,B9,B91,B93,C14,C17,C2,C20,C38,C46,C55,C76,C78,C82,C83,D11
`Chr1:19085889`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr1:19085889`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr1:19085904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:19085908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:19085930`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	11	A22,B120,B130,B40,B58,B84,B90,C28,C41,C43,D10
`Chr1:19086096`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr1:19086096`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918118.1
CTACAACCACCACTTCCAATGCATCTTGCAAAGCCAATATCTCAAAATGTTTTATTTTACTATGGTCAATGGACTCGATCCATTGAATCTCTCGTTTTAGGAAAATTTGAGTATAAACGTTGGCAGGGAATTTGGGTGCCTGGGCCATCAATAAATAATACACATCTTGTGTTTGGAGTGAAGATTGAAATGCGAGATGAGTTGAGAATCAACATATCACTTGAGGACTATTATATGAAGGTCAAAGAATGGGAAGACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993257
ATGCATCTTGCAAAGCCAATATCTCAAAATGTTTTATTTTACTATGGTCAATGGACTCGATCCATTGAATCTCTCGTTTTAGGAAAATTTGAGTATAAACGTTGGCAGGGAATTTGGGTGCCTGGGCCATCAATAAATAATACACATCTTGTGTTTGGAGTGAAGATTGAAATGCGAGATGAGTTGAGAATCAACATATCACTTGAGGACTATTATATGAAGGTCAAAGAATGGGAAGACAGATATCATCAATTCACTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774101.1
MHLAKPISQNVLFYYGQWTRSIESLVLGKFEYKRWQGIWVPGPSINNTHLVFGVKIEMRDELRINISLEDYYMKVKEWEDRYHQFTWLIHQPNVVYDSARNVVNASKETWDTIATVRPEMCVYMEEGEFNSARLTLLFEEIIKNEESAQRFNIPTNSGASYFSEVVDQPNATGVNGSPQSFSSWSREI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器