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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002176`

染色体: Chr07 坐标: 19940805-19944157 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002176`
名称	SmilChr07G002176
描述	uncharacterized SmilChr07G002176
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	19940805 - 19944157 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993259`
GeneID	`130993259`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993259`
原始查询	`LOC130993259`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0282700; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0282700; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0282700` - identity=34.6; qcov=0.623; evalue=7.82e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14303 (NAM-associated)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993259

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774066.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774066.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774066.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774066.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774066.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:19940855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,C1,C5
`Chr7:19940896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:19940899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C41
`Chr7:19940901`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	B10,B114,B137,B139,B14,B17,B20,B25,B37,B43,B65,B67,B83,C11,C29,C31,C74
`Chr7:19940902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr7:19940910`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B140,B22,B25,B83,C38
`Chr7:19940910`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B140,B22,B25,B83,C38
`Chr7:19940912`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	67	A10,A25,A3,A4,B10,B100,B104,B111,B114,B115,B120,B124,B128,B129,B137,B139,B14,B17,B2,B20,B21,B25,B29,B32,B34,B35,B36,B37,B43,B46,B54,B56,B57,B6,B65,B66,B67,B69,B71,B72,B83,B85,B92,B96,C1,C12,C13,C19,C27,C29,C31,C37,C39,C4,C44,C50,C53,C55,C59,C63,C66,C67,C7,C74,C83,D6,D9
`Chr7:19940922`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B95,C29,C54
`Chr7:19940936`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B95,C29,C54
`Chr7:19940957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,C1,C48
`Chr7:19940962`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C27,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774067.1

162 aa

162

NAM-associated

PF14303 NAM-associated 34-161 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774067.1`	Pfam	`PF14303`	NAM-associated	Family	34	161	1.8e-07	32.9	No apical meristem-associated C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918083.1
ATGTTAGCAAATGGTCTTTGTTGAGGCTATATTCTTATGGCTAAGTCTTGTCTGTAAGTTTTCTGCTTGATCTATTTAAGTTGGTATGGAAATGCTAACTCGTAGTCATTGTTGAGGCTATATTCTTCCAGTTAAGCTGCACAATCCTCTTAACAGTCTGGTATTGTTCTGATTGGTGGATACAGGCCTCTAGATCAGCCATTTATAATGGCTATGTCGAACTTGTCATTACCATTACCGTTTGAGTTAGGTCATCATCA...

XM_057918084.1
ATGTTAGCAAATGGTCTTTGTTGAGGCTATATTCTTATGGCTAAGTCTTGTCTGTAAGTTTTCTGCTTGATCTATTTAAGTTGGTATGGAAATGCTAACTCGTAGTCATTGTTGAGGCTATATTCTTCCAGTTAAGCTGCACAATCCTCTTAACAGTCTGGTATTGTTCTGATTGGTGGATACAGGCCTCTAGATCAGCCATTTATAATGGCTATGTCGAACTTGTCATTACCATTACCGTTTGAGTTAGGTCATCATCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993259
ATGGACTACTACAAAACATGCCACAACAATTGGGGTAGCGGAATGAGCGAAGATCAAATCACCGAAGCCACCCAAAAGATGTTCGAGGCTCACCACAAGAAGAAATTAGGCTATATGAGCGCTTGGAAAGTCCTACGCGAGTGTCAAAAGTTCATGACGGAAGCCACCGATGTCCACTCCACCAAGAAGTTGAAGGGATCCGACGGCGAAGTTAATAGTACTTCATCGGAGCCGAGCATCACCACGAGGCCCCAAGGGAC...

LOC130993259
ATGTCCATCATTTTTCAAGTGTATCTTTTAGAGCAACTCCAATGCTTAGGTCGAAGGGAGGGGTCGAAACGGCCAGAGCGAAGACCTCCGCGCTGGCGACCCGTGCGACGTCGAAGCGAGGTCGAGGCGGAGACCCGGGACGACGGCTGCGATGAGAAATGCGGCGGAAGCTTGGGTGTGCCTAACACTCAACCGATGATGGGGTTTGCTCCATTTTCTGAAGCTTCAAACGTCTTTGCTTTGGGTGTGCCTACTACTCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057774066.1
MSIIFQVYLLEQLQCLGRREGSKRPERRPPRWRPVRRRSEVEAETRDDGCDEKCGGSLGVPNTQPMMGFAPFSEASNVFALGVPTTQPTRLPTVEEEEAEAKPGVTCTNYSGDETELICILWAEGTHNPILGTSQKLHQYWGSIAEKYAFKPSGAPTRKADVIKSHFGRVSRET

XP_057774067.1
MDYYKTCHNNWGSGMSEDQITEATQKMFEAHHKKKLGYMSAWKVLRECQKFMTEATDVHSTKKLKGSDGEVNSTSSEPSITTRPQGTKAAKLDKGNGKKGEASSMTTQSSYSEALEKVAVETKEHSAQIGGIAEAKKTLASVKMEELDLKILNMDTLNMNEA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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