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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002187`

染色体: Chr07 坐标: 20091018-20094834 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002187`
名称	SmilChr07G002187
描述	WEB family protein At5g16730, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20091018 - 20094834 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993269`
GeneID	`130993269`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993269`
原始查询	`LOC130993269`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WEB family protein At5g16730, chloroplastic-like
产物	WEB family protein At5g16730%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G16730` (AT5G16730) weak chloroplast movement under blue light protein (DUF827) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831536] identity=48.5; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0592400` - identity=36.2; qcov=0.831; evalue=4.52e-85; confidence=medium
GO	GO:0007131 (reciprocal meiotic recombination)
KEGG	-
Pfam	PF05701 (WEMBL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993269

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057774080.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057774080.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057774080.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774080.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774080.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:20092224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr7:20092679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B93
`Chr7:20092712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr7:20092750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr7:20093032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B71
`Chr7:20093032`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr7:20093042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B28,B65,C12
`Chr7:20093067`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr7:20093106`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr7:20093487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr7:20093575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:20093701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774080.1

847 aa

424

847

WEMBL

PF05701 WEMBL 78-481 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774080.1`	Pfam	`PF05701`	WEMBL	Coiled-coil	78	481	3.9e-18	66.2	Weak chloroplast movement under blue light

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918097.1
GAAAAAAGCAGAGGACATTTTTTTTGTGAAGGAAAAAAAAAAAAGCAGAGGACATTGATACACTGAGTTTCTGACAAAGTTTTACAGGAAGCCTACTTGCGTAAATCCAACCCCACTGAGAGAGAGCAGTTGCCGTGCTGAGTAGACAGACGACACCGTTCCAAATCATCTATTTTTTTTTTGCAGTAAATTCTTCCCCACGACCTCATCCATTTCTCCCTCCTCTCTCTGCATTTCCCTCCTTTCTCTCTCTACACACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993269
ATGTCTACCAAGCGATCTGCTGTATCTGGAGCTCCCACTCCCACTAAAGTATCAGTGGCAACTACTCGCGTGAGCAAGAGTAGCAGCAGGGGAGCAGCTAAATCCAATGCGGATGCAGCTTCTCCCCTGCAAACTTCTCGTCTCTCATCAGTTGATCGCTCCCCAAGATCTCTTCCGTCAAAGCCTGCACTCGACCGCCGCTCTCCCAAACTCACTACCCCGCCTGAAAAAAAGGCGACTCGTGTTTCAAAACCGTCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774080.1
MSTKRSAVSGAPTPTKVSVATTRVSKSSSRGAAKSNADAASPLQTSRLSSVDRSPRSLPSKPALDRRSPKLTTPPEKKATRVSKPSQVQPELDLAQEELKKAEEKLVLVQNEKDKALDELKEARRLGEEANEKLREALIAQKRAEESSEIEKFRAVEMEQAGIEAAQRNEEEWQKELETLREKHAVDVAALLSATEEIQKVKQELALIIDAKDQALQHVQDATKIAEAHAQKVEALSAELAHMKSVLDSRVEMEASENDK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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