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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002211`

染色体: Chr07 坐标: 20377246-20379523 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002211`
名称	SmilChr07G002211
描述	60S ribosomal protein L13-1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20377246 - 20379523 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993292`
GeneID	`130993292`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993292`
原始查询	`LOC130993292`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L13-1-like
产物	60S ribosomal protein L13-1-like
Arabidopsis	`AT3G49010` (BBC1) breast basic conserved 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824062] identity=84.3; qcov=0.955; evalue=9.94e-122; confidence=high
Rice	`Os06g0115500` - identity=80.2; qcov=0.985; evalue=4.68e-117; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01294 (Ribosomal_L13e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993292

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057774109.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774110.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057774110.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774109.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774109.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:20378255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B101
`Chr7:20378536`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr7:20378561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,D6
`Chr7:20378574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,C2,C45,C77
`Chr7:20378593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr7:20378956`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr7:20378978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B33,C53
`Chr7:20379070`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B15,C51
`Chr7:20379070`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B15,C51
`Chr7:20379071`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	49	A10,A24,B10,B105,B109,B114,B121,B127,B129,B137,B18,B2,B23,B24,B27,B28,B33,B40,B5,B53,B6,B61,B63,B73,B76,B83,C1,C10,C18,C2,C22,C26,C3,C35,C4,C40,C43,C47,C53,C63,C67,C71,C78,C81,C84,C87,C9,D6,D7
`Chr7:20379100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,C20,C6,C65
`Chr7:20379111`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	75	A1,A11,A15,A16,A19,A24,A3,A7,A9,B106,B110,B111,B117,B119,B12,B120,B123,B13,B131,B138,B139,B19,B21,B25,B31,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B41,B45,B50,B52,B57,B58,B59,B60,B67,B69,B70,B72,B74,B77,B9,B94,B98,B99,C15,C20,C27,C28,C31,C34,C4,C40,C42,C49,C55,C56,C59,C6,C64,C65,C66,C7,C73,C75,C76,C80,D10,D2,D6,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774109.1

228 aa

114

228

Ribosomal_L13e

PF01294 Ribosomal_L13e 6-212 aa

XP_057774110.1

200 aa

100

200

Ribosomal_L13e

PF01294 Ribosomal_L13e 6-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774109.1`	Pfam	`PF01294`	Ribosomal_L13e	Family	6	212	6.4e-71	238.7	Ribosomal protein L13e
`XP_057774110.1`	Pfam	`PF01294`	Ribosomal_L13e	Family	6	184	7.5e-77	258.0	Ribosomal protein L13e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918127.1
GCTTCCATTCTTTTCAAAAAAAAAAAGAAAAAAATCGCTTCCAAATATATTGGGCCTTTTCAAACGGCCCATATTTACGGCCCAAGACAATGAGGTAGGGTTTATCTTCGATGTATACATATTTTATCAACGCAGTCGCCATTCTAAAATAGAAGCAGAGCTCCACTCCTTCCGCCACGGCCCCAACCCTCGCTACCATAAATCATGAAGCATAACAATGTTATCCCAAATGGGCACTTCAAGAAGCACTGGCAAAACTA...

XM_057918126.1
TTGGGCCTTTTCAAACGGCCCATATTTACGGCCCAAGACAATGAGGTAGGGTTTATCTTCGATGTATACATATTTTATCAACGCAGTCGCCATTCTAAAATAGAAGCAGAGCTCCACTCCTTCCGCCACGGCCCCAACCCTCGCTACCATAAATCATGAAGCATAACAATGTTATCCCAAATGGGCACTTCAAGAAGCACTGGCAAAACTACGTGAAAACTTGGTTTAACCAGCCTGCCCGAAAGGCCAGGAGAAGGACC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993292
ATGAAGCATAACAATGTTATCCCAAATGGGCACTTCAAGAAGCACTGGCAAAACTACGTGAAAACTTGGTTTAACCAGCCTGCCCGAAAGGCCAGGAGAAGGACCGCACGACAAGAGAAAGCTGTTAAGATTTTCCCCAGACCTACGGCTGGACCCCTTCGTCCCGTTGTCCGTGGGCAAACACTGAAGTACAACATGAAAGTCAGAGCTGGCAGGGGATTTTCTCTTGAGGAGCTTAAGGCTGCAGGCGTCCCTAAGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057774109.1
MKHNNVIPNGHFKKHWQNYVKTWFNQPARKARRRTARQEKAVKIFPRPTAGPLRPVVRGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGVPKKLAPTIGISVDHRRRNSSLEGFQTNVQRLKTFKAKLVVFPRRVRKFKVKWALERMKLFFFLVIVDLLYAHPFLFQAGDSTPEELATATQVAGPYMPIVREKPTMDLVKVTEEMKLFKAYDKLRLERTNARHVGVRAKRAAEA

XP_057774110.1
MKHNNVIPNGHFKKHWQNYVKTWFNQPARKARRRTARQEKAVKIFPRPTAGPLRPVVRGQTLKYNMKVRAGRGFSLEELKAAGVPKKLAPTIGISVDHRRRNSSLEGFQTNVQRLKTFKAKLVVFPRRVRKFKAGDSTPEELATATQVAGPYMPIVREKPTMDLVKVTEEMKLFKAYDKLRLERTNARHVGVRAKRAAEA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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