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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002212`

染色体: Chr07 坐标: 20380928-20385839 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002212`
名称	SmilChr07G002212
描述	aluminum-activated malate transporter 4-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20380928 - 20385839 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993293`
GeneID	`130993293`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993293`
原始查询	`LOC130993293`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aluminum-activated malate transporter 4-like
产物	aluminum-activated malate transporter 4-like
Arabidopsis	`AT3G18440` (ALMT9) aluminum-activated malate transporter 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821373] identity=52.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0730600` (OsSTA74) - identity=53.1; qcov=0.853; evalue=3.37e-174; confidence=high
GO	GO:0009705 (plant-type vacuole membrane); GO:0015743 (malate transport)
KEGG	-
Pfam	PF11744 (ALMT); PF13515 (FUSC_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993293

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057774111.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057774111.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057774111.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774111.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774111.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:20381453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B113,C41,C74
`Chr7:20381545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr7:20382148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,D11
`Chr7:20382240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,B137
`Chr7:20382294`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	25	A18,A23,A3,B117,B122,B137,B140,B15,B36,B47,B5,B50,B70,C13,C19,C20,C24,C37,C52,C55,C61,C70,C72,C79,D1
`Chr7:20382308`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	23	A18,A23,A3,B117,B122,B140,B15,B36,B47,B5,B50,B70,C13,C19,C20,C24,C52,C55,C61,C70,C72,C79,D1
`Chr7:20382609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr7:20384945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr7:20384949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,C18,C24
`Chr7:20384953`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	124	A1,A10,A11,A18,A2,A23,A24,A25,A3,A4,A9,B10,B101,B104,B105,B109,B112,B113,B123,B126,B129,B135,B139,B19,B2,B21,B22,B23,B24,B26,B27,B28,B29,B3,B33,B34,B35,B39,B40,B41,B43,B45,B46,B48,B5,B50,B52,B53,B54,B56,B57,B6,B61,B62,B63,B66,B68,B7,B70,B72,B73,B75,B76,B80,B83,B86,B87,B9,B91,B94,B96,B98,B99,C1,C10,C14,C17,C18,C2,C22,C28,C3,C32,C33,C35,C37,C4,C40,C41,C43,C44,C46,C47,C48,C53,C55,C56,C58,C6,C62,C63,C64,C67,C68,C7,C71,C72,C73,C74,C78,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D11,D2,D3,D6,D7
`Chr7:20384955`	`C`	`CT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	125	A1,A10,A11,A18,A2,A23,A24,A25,A3,A4,A9,B10,B101,B104,B105,B109,B112,B113,B123,B126,B129,B135,B139,B19,B2,B21,B22,B23,B24,B26,B27,B28,B29,B3,B33,B34,B35,B39,B40,B41,B42,B43,B45,B46,B48,B5,B50,B52,B53,B54,B56,B57,B6,B61,B62,B63,B66,B68,B7,B70,B72,B73,B75,B76,B80,B83,B86,B87,B9,B91,B94,B98,B99,C1,C10,C14,C17,C18,C2,C22,C28,C3,C32,C33,C35,C37,C4,C40,C41,C43,C44,C46,C47,C48,C53,C55,C56,C58,C6,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C7,C71,C72,C73,C74,C78,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D11,D2,D3,D6,D7
`Chr7:20384957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C63,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774111.1

580 aa

290

580

ALMT

FUSC_2

PF11744 ALMT 69-548 aa PF13515 FUSC_2 106-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774111.1`	Pfam	`PF11744`	ALMT	Family	69	548	9.7e-177	589.3	Aluminium activated malate transporter
`XP_057774111.1`	Pfam	`PF13515`	FUSC_2	Family	106	228	1.1e-11	45.6	Fusaric acid resistance protein-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918128.1
GAAACATCTTATTATAAAAAAATGGGACATTTAGAACTTATTATTGCTCGTTATTCATTACCTAGTACTACTATTATATACAAGCACAAGCAAAAGAAGATACTTAATTACGACATTCATCTTCTTCATCAAAAAGTGAAACTTATCCCTTCCCATATTCGTACATTCAGATTCTTTTCAACGCTCACCTACAAAAAAAAAATATGCGAGTCGAACTCGCCAGCATAGTACCAAACATTCGGAAATTTCCCAACCGCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993293
ATGGCCGGTAATTTTGGGTCGTTGAGACAGAGCTTTGTAGAGAGAGGGAAAGAGCGGCTGCTGTCGAGAAAGTACTACTCGGAGGTGGAATTGGACGACTACTACGTCAGACATGAGGGCTGCTTCCACTGGCTCTTCCGAATCATGGGAGAGAGCTTGTCGAGGTGGTGGAAGAGTCTCGAGGAGATTGCAGTTAGCGCCTACCAGATGGGAAGATCCGACCCGAGAAAGGCCATGTTCGCCGCCAAAATGGGCTGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774111.1
MAGNFGSLRQSFVERGKERLLSRKYYSEVELDDYYVRHEGCFHWLFRIMGESLSRWWKSLEEIAVSAYQMGRSDPRKAMFAAKMGCALSLVSLLIFFKEPSTYITKHSIWAILTVVVVFEFSIGATLNKGFNRALGTFSAGALSLGIAELAKLAGEFQEVVVVISIFIAGFLSSYLKLHPAVKQYEYGFRVFMLTFCIVLVSDSSEFLQTAVSRLVLIACGAGVCLVVNVCIFPIWSGEDLHKLVVKNIKGVATSLEGCI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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