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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002217`

染色体: Chr07 坐标: 20411098-20417709 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002217`
名称	SmilChr07G002217
描述	protein RESPONSE TO LOW SULFUR 2-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20411098 - 20417709 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993299`
GeneID	`130993299`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993299`
原始查询	`LOC130993299`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RESPONSE TO LOW SULFUR 2-like
产物	protein RESPONSE TO LOW SULFUR 2-like
Arabidopsis	`AT5G24660` (LSU2) response to low sulfur 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832538] identity=44.8; qcov=0.777; evalue=2.24e-15; confidence=low
Rice	`Os10g0509600` - identity=47.8; qcov=0.411; evalue=3.4e-06; confidence=low
GO	GO:0098869 (cellular oxidant detoxification)
KEGG	-
Pfam	PF24980 (LSU)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993299

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057774116.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057774116.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057774116.1`
4	Spindle	Spindle	0.20000	`XP_057774116.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774116.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:20417372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774116.1

112 aa

112

LSU

PF24980 LSU 20-75 aa

XP_057774117.1

112 aa

112

LSU

PF24980 LSU 20-75 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774116.1`	Pfam	`PF24980`	LSU	Coiled-coil	20	75	4.3e-08	33.8	Response to Low Sulfur (LSU) family
`XP_057774117.1`	Pfam	`PF24980`	LSU	Coiled-coil	20	75	4.3e-08	33.8	Response to Low Sulfur (LSU) family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918133.1
AAAAATAAAATTTTAACTTTCTTAAAAGAAAAGTAACATACATGTAAAGTTGGTTTCATTATAGACGCTAACATACACACAAAAGTTTGAACCCCTCAATATGGAATTTATCATGCATTTATAAAGTTGAAGACGAGAATTTGGAGTGCGTAACGCAATGAGTAATTATTAGATGTTGACATAGTAATGAAACACAGATGGCTCCAACGATCGCCGTGCCGATCTCCGGGAACCGGCGCGAGGCGGCGGCGGCGGAGACG...

XM_057918134.1
AATGAGTAATTATTAGATGTTGACATAGTAATGGTATGTGATAAGGGTTGGGAGTCGATCGAGAGGTCAATTTATGTATCTAAATAGTTAAACACAGATGGCTCCAACGATCGCCGTGCCGATCTCCGGGAACCGGCGCGAGGCGGCGGCGGCGGAGACGCTGAAGAGGAGGAATGAAGAGCTGGAGAAGGAGCTGAGGGATAGCCTGGAGAGGGAGGAGAGAATGAAGGAAGAGCTGCGGATGACGTGGGAGCGGGTGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993299
ATGGCTCCAACGATCGCCGTGCCGATCTCCGGGAACCGGCGCGAGGCGGCGGCGGCGGAGACGCTGAAGAGGAGGAATGAAGAGCTGGAGAAGGAGCTGAGGGATAGCCTGGAGAGGGAGGAGAGAATGAAGGAAGAGCTGCGGATGACGTGGGAGCGGGTGCGGTTGGCGGAGGAGGGTGCGGAGAGGCTGTGCAGCCAGCTCGGCGAGCTCGAGGCGGAGGCCGTCGATCATGTCAGGGAATCTACGGCACAGATTAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057774116.1
MAPTIAVPISGNRREAAAAETLKRRNEELEKELRDSLEREERMKEELRMTWERVRLAEEGAERLCSQLGELEAEAVDHVRESTAQITLLMDKLSLAHKLLQDASIDAISLTQ

XP_057774117.1
MAPTIAVPISGNRREAAAAETLKRRNEELEKELRDSLEREERMKEELRMTWERVRLAEEGAERLCSQLGELEAEAVDHVRESTAQITLLMDKLSLAHKLLQDASIDAISLTQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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