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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002224`

染色体: Chr07 坐标: 20467338-20470900 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002224`
名称	SmilChr07G002224
描述	uncharacterized calcium-binding protein At1g02270-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20467338 - 20470900 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993302`
GeneID	`130993302`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993302`
原始查询	`LOC130993302`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Calcium-binding endonuclease/exonuclease/phosphatase family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835500]; symbol=AT5G54130; hit=AT5G54130; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Calcium-binding endonuclease/exonuclease/phosphatase family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835500]; symbol=AT5G54130; hit=AT5G54130; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G54130` (AT5G54130) Calcium-binding endonuclease/exonuclease/phosphatase family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835500] identity=70; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0203000` - identity=61.4; qcov=0.962; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000175 (3'-5'-RNA exonuclease activity); GO:0005509 (calcium ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993302

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057774123.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057774123.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057774123.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774123.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774123.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:20467610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B111,B127,B132,B71,C26
`Chr7:20467641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B101
`Chr7:20468064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr7:20468066`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,D4
`Chr7:20468088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr7:20468821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C51
`Chr7:20469279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr7:20469291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,C26
`Chr7:20469327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A13
`Chr7:20469415`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr7:20470035`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:20470229`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B78,B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774123.1

444 aa

222

444

Exo_endo_phos

PF03372 Exo_endo_phos 58-255 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774123.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	58	255	4.3e-09	37.2	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918140.1
ACACACACAACACACACACATAAATCCACACACCACCATTCCCCTCTCTCTCCTCCTCCTCTAACTTTACTTCTCTCTCATTCTCAGATAAATAAAGCCACCGTCACCACCATCATTGTGAGGAGCTAACAACATCTTTGTATTCGTTGGTTGCATTTCCGTCCATCGCCACCTGCGAAACAAACACAATATTATCGTCATTCCTCTCTTAGCATTATTAAGCTCTTGTTTCATTGGAACTTGAATTTTTTACGTATTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993302
ATGGGGAGGAAGAGCAATGGAAGGGTTTCGAGAATTGGCAGTTACGCGATAGCTTCATCAATTACGGATGCAACTTGTTTTTCTTGCACGACTTTCAACATCCTTGCTCCTATTTACAAAAGACTCAATCACGAGGATCCTAAATGTAGAGAAAGCGACGTTAAGCAAATTTGGCTTAAGAGAAATAAAAGGATTTTGGATTGGTTACTGTGTGAAAGATCTTCTATTATCTGCCTTCAGGAATTTTGGGTTGGGAATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774123.1
MGRKSNGRVSRIGSYAIASSITDATCFSCTTFNILAPIYKRLNHEDPKCRESDVKQIWLKRNKRILDWLLCERSSIICLQEFWVGNEELVSIYDKRLGDAGYDSFKLARTNNRGDGLLIAVHKDYFRVINHKELLFNDFGDRVAQLLHVELIPRFSQCRSNCIRQEILIVNTHLLFPHDSSLCLERLRQIYKILQYVESYQKDKKLNPLPILLCGDLNGSKSGHVYKFLRSQGFISSYDAAHLYTDADAHKWVSHRNHRG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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