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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002223`

染色体: Chr07 坐标: 20462199-20464696 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002223`
名称	SmilChr07G002223
描述	40S ribosomal protein S4-1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	20462199 - 20464696 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993305`
GeneID	`130993305`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993305`
原始查询	`LOC130993305`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S4-1-like
产物	40S ribosomal protein S4-1-like
Arabidopsis	`AT5G58420` (AT5G58420) Ribosomal protein S4 (RPS4A) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835955] identity=90.8; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0368300` - identity=87.1; qcov=1; evalue=1.52e-175; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00467 (KOW); PF00900 (Ribosomal_S4e); PF01479 (S4); PF08071 (RS4NT); PF16121 (40S_S4_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993305

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774125.1`
2	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057774125.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057774125.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774125.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774125.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774125.1

264 aa

132

264

RS4NT

Ribosomal_S4e

KOW

40S_S4_C

PF08071 RS4NT 3-39 aa PF01479 S4 48-90 aa PF00900 Ribosomal_S4e 95-169 aa PF00467 KOW 177-202 aa PF16121 40S_S4_C 212-258 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774125.1`	Pfam	`PF08071`	RS4NT	Domain	3	39	1.2e-18	67.5	RS4NT (NUC023) domain
`XP_057774125.1`	Pfam	`PF01479`	S4	Domain	48	90	4e-05	24.0	S4 domain
`XP_057774125.1`	Pfam	`PF00900`	Ribosomal_S4e	Family	95	169	2.7e-34	117.5	Ribosomal family S4e
`XP_057774125.1`	Pfam	`PF00467`	KOW	Family	177	202	2.5e-07	31.0	KOW motif
`XP_057774125.1`	Pfam	`PF16121`	40S_S4_C	Family	212	258	2.9e-25	88.3	40S ribosomal protein S4 C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918142.1
AGAACAATAGATACATAGATGGGCCGAGAAGCATTGCAGCCCACATTCGAGCATCCCTAATTACCCTTCTTCGCTCGCTCTCGTATATAAACTTGTTGCTAGGGTTTAATAATTTCTCCGCAGCTTGAATACACCAGACCAGAGCTGAGTGAGGAGTGACGCGAGGGAGGGGCGCAGCCGTAGGTTCTCACATCCGACTCCAATATGGCGAGAGGTTTGAAGAAACATTTGAAGAGGCTCAATGCCCCCAGTCATTGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993305
ATGGCGAGAGGTTTGAAGAAACATTTGAAGAGGCTCAATGCCCCCAGTCATTGGATGTTGGACAAGCTTGGTGGTGCTTTTGCTCCCAAACCATCATCTGGACCCCACAAATCCAGGGAATGCCTGCCGTTGATTCTGATACTGAGAAACAGGCTCAAGTATGCTCTTACTTACCGCGAGGTTATTTCTATATTGATGCAACGTCACATTCAGGTTGATGGAAAGGTTAGGACTGACAAGACTTATCCTGCTGGTTTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774125.1
MARGLKKHLKRLNAPSHWMLDKLGGAFAPKPSSGPHKSRECLPLILILRNRLKYALTYREVISILMQRHIQVDGKVRTDKTYPAGFMDVVSIPKTNENFRLLYDTKGRFRLHSIRDEEAKFKMCKVRSVQFGKKGIPYINTFDGRTIRYPDPLIKANDTIKLDLDSNKIVDFIKYDVGNVVMVTGGRNRGRVGVIKNREKHKGSFETLHIQDASGHEFATRSGNVFTIGKGTKPWISLPKGKGIKLTIIEEARKRIQAQS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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