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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002287`

染色体: Chr07 坐标: 21153841-21155010 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002287`
名称	SmilChr07G002287
描述	uncharacterized protein At4g00950-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21153841 - 21155010 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993367`
GeneID	`130993367`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993367`
原始查询	`LOC130993367`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835382]; symbol=AT5G53030; hit=AT5G53030; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835382]; symbol=AT5G53030; hit=AT5G53030; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G53030` (AT5G53030) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835382] identity=36.9; qcov=1.02; evalue=2.51e-23; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05097 (DUF688)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993367

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057774212.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057774211.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057774211.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774212.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774212.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21154057`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	61	A13,A19,A5,A6,A8,B101,B106,B11,B114,B115,B125,B126,B133,B134,B137,B138,B14,B16,B17,B29,B30,B31,B36,B40,B48,B53,B55,B56,B61,B66,B67,B7,B75,B76,B80,B81,B82,B90,B92,B94,B95,B96,B97,C10,C15,C20,C21,C23,C25,C36,C38,C43,C49,C5,C51,C85,C87,D1,D5,D8,D9
`Chr7:21154096`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	B16,B2,B49,B69,C18,C24,C30,C34,C41,C60,C70,C73,D9
`Chr7:21154128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B129
`Chr7:21154395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C86
`Chr7:21154395`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr7:21154416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr7:21154422`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:21154475`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D4
`Chr7:21154477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr7:21154489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B109,B138,B9,D6
`Chr7:21154543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr7:21154605`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B114,C37,C53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774211.1

208 aa

104

208

DUF688

PF05097 DUF688 30-63 aa

XP_057774212.1

194 aa

194

DUF688

PF05097 DUF688 30-63 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774211.1`	Pfam	`PF05097`	DUF688	Family	30	63	0.00033	20.7	Protein of unknown function (DUF688)
`XP_057774212.1`	Pfam	`PF05097`	DUF688	Family	30	63	0.00032	20.8	Protein of unknown function (DUF688)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918229.1
GGAACCATTATTAACCTTCAAACTCATTTATTCAATTTGACCAAACACTCTAAATTTTCAATATTAATTTAAACATGAATAAGAAGGAGCACAACTGACCGTTACCATCCACTTGTTTACTCTCGTGAGCAGTTGAACCGAGGAGCCTCACCTCATATTCAAATACATTTATAACCAACCAGTGTATATATTCGCCCCCAGCTGAAACACGACTAGCTCCTTACCATGGGCATCAAACTAGAAGATCACCACAGACCTAC...

XM_057918228.1
CTGGAACCATTATTAACCTTCAAACTCATTTATTCAATTTGACCAAACACTCTAAATTTTCAATATTAATTTAAACATGAATAAGAAGGAGCACAACTGACCGTTACCATCCACTTGTTTACTCTCGTGAGCAGTTGAACCGAGGAGCCTCACCTCATATTCAAATACATTTATAACCAACCAGTGTATATATTCGCCCCCAGCTGAAACACGACTAGCTCCTTACCATGGGCATCAAACTAGAAGATCACCACAGACCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993367
ATGGGCATCAAACTAGAAGATCACCACAGACCTACACTTACTCTATCCAAACTCCCATATTGCAAGCCCAGAGAGCCGCCACAGCCCATGCAGACGCCGCCTCTCCGCCCGTCCGCCTCGATCCCGTTCCACTGGGAGGAGGCGCCGGGAAAGCCAAGAGCCGGTGGTTCGCCATGTTCGAAGAGCAAGAGCAAGAGCGCGAGGTGTCTGGAGCTGCCGCCGAGGCTGGTGCATGAAGAGGCCAAAATGACAATGACATT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057774211.1
MGIKLEDHHRPTLTLSKLPYCKPREPPQPMQTPPLRPSASIPFHWEEAPGKPRAGGSPCSKSKSKSARCLELPPRLVHEEAKMTMTLMTPSPTTVLDGPYVGRSLSLACTFSFRKGPVPDGKRNLGSGRWGSERKLGRGSMDFSQSLGDIFRSEDNLKLRRRRSFFGLSTINSKYLVTFMRVLSRRCRGGVAHEMMINEDFGMLKIYI

XP_057774212.1
MGIKLEDHHRPTLTLSKLPYCKPREPPQPMQTPPLRPSASIPFHWEEAPGKPRAGGSPCSKSKSKSARCLELPPRLVHEEAKMTMTLMTPSPTTVLDGPYVGRSLSLACTFSFRKGPVPDGKRNLGSGRWGSERKLGRGSMDFSQSLGDIFRSEDNLKLRRRRSFFGLSTINSKYLWGDIYASFKQAVSWRRSP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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