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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002306`

染色体: Chr07 坐标: 21331697-21332916 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002306`
名称	SmilChr07G002306
描述	protein phosphatase 2C 51-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21331697 - 21332916 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993385`
GeneID	`130993385`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993385`
原始查询	`LOC130993385`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein phosphatase 2C 51-like
产物	protein phosphatase 2C 51-like
Arabidopsis	`AT4G11040` (AT4G11040) Protein phosphatase 2C family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826705] identity=29.4; qcov=0.786; evalue=2.25e-18; confidence=low
Rice	`Os01g0656200` (OsPP2C08) - identity=28.1; qcov=1.08; evalue=6.42e-16; confidence=low
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0005829 (cytosol); GO:0006470 (protein dephosphorylation)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00481 (PP2C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993385

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774240.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057774240.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057774240.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774240.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774240.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21331945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B113,C46
`Chr7:21331966`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	186	A1,A10,A11,A13,A14,A16,A18,A19,A20,A22,A3,A4,A5,A6,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B103,B104,B105,B106,B107,B109,B11,B110,B114,B115,B118,B119,B12,B124,B125,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B14,B140,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B34,B36,B37,B40,B42,B43,B45,B46,B47,B48,B49,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B57,B59,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B85,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B95,B97,B98,C1,C11,C12,C15,C16,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C31,C32,C33,C36,C37,C38,C4,C40,C41,C42,C43,C45,C46,C49,C5,C52,C54,C55,C57,C59,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C85,C86,C87,C9,D1,D11,D2,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr7:21331975`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A18,B123,B35,B49,B60,B79,B99,C13,C23,C48,C56,D10
`Chr7:21332142`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C20
`Chr7:21332142`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C20
`Chr7:21332621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B28,B65,C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774240.1

294 aa

147

294

PP2C

PF00481 PP2C 219-275 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774240.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	219	275	6e-09	36.7	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918257.1
CGAGTGTCAATTAAGATTTTGACAATTCGACACGATAAATGAGTGGATAGGAGGATTAATTAAACATGAACACAAACACGAATTGCGTCAAAAATTAGCAGCATAGTGTTTCCAACCAATTTAAATCGTAGAAACAGTTAGTTTAGTGGAGTGAGAGGGATGAGTGATGAGTCATGGAAAATTTGGAGGTCTGAGCATGAAGCTCCCACGTGTCCCTCCCTTAACCGCCGCAATTCCCATGAACATCTGCCTTCTTCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993385
ATGAGTCATGGAAAATTTGGAGGTCTGAGCATGAAGCTCCCACGTGTCCCTCCCTTAACCGCCGCAATTCCCATGAACATCTGCCTTCTTCCAACCACCCACCACCCTTTCACTTTCACATCATCCGCCATGACTCTGGATAGCTGCCTCACGCCGCCGCCGGAGACTACTCTTCGCAGGCACAAGCATCCCTTCCTGTCCTCCAAATCCGCCGAATCTCACGCCACCAAGTCCGCCAGAGATGCTCGCCGGAGAAGACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774240.1
MSHGKFGGLSMKLPRVPPLTAAIPMNICLLPTTHHPFTFTSSAMTLDSCLTPPPETTLRRHKHPFLSSKSAESHATKSARDARRRRLDLRRIKSSPPDSSEVLRSSYGKISVVGRRRAMDDALAVELGFVKRGGESYDFFGVFDGHERKRVAREMLAEIVGEEATEKEEVKRMSGSGVAAVVGGSEVVVAGSKAVVCRGGAAVRLLESDEACVRFARRHADEFLILGSGGFWDGISGDLACQIATRYCGGGSGGAEAAAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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