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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002318`

染色体: Chr07 坐标: 21446943-21452346 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002318`
名称	SmilChr07G002318
描述	dihydrofolate synthetase
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21446943 - 21452346 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993398`
GeneID	`130993398`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993398`
原始查询	`LOC130993398`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dihydrofolate synthetase
产物	dihydrofolate synthetase
Arabidopsis	`AT5G41480` (GLA1) Folylpolyglutamate synthetase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834149] identity=56.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0623800` - identity=48.1; qcov=0.475; evalue=1.07e-56; confidence=medium
GO	GO:0004326 (tetrahydrofolylpolyglutamate synthase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0005829 (cytosol); GO:0046901 (tetrahydrofolylpolyglutamate biosynthetic process)
KEGG	smil00790 (Folate biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02875 (Mur_ligase_C); PF08245 (Mur_ligase_M)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993398

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057774258.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057774259.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057774259.1`
4	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057774258.1`
5	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057774258.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21447103`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:21448492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B113,C46,C61,C84
`Chr7:21448503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B56,B96,C82
`Chr7:21448523`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr7:21448603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:21448992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,C19,C31
`Chr7:21450038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr7:21450098`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B70,C40,C55
`Chr7:21450139`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,C30,C73,D3,D9
`Chr7:21450149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B35,B99,C23
`Chr7:21450588`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:21451352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B70,C40,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774258.1

552 aa

276

552

Mur_ligase_M

Mur_ligase_C

PF08245 Mur_ligase_M 97-341 aa PF02875 Mur_ligase_C 385-447 aa

XP_057774259.1

507 aa

254

507

Mur_ligase_M

Mur_ligase_C

PF08245 Mur_ligase_M 52-296 aa PF02875 Mur_ligase_C 340-402 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774258.1`	Pfam	`PF08245`	Mur_ligase_M	Domain	97	341	2e-13	51.5	Mur ligase middle domain
`XP_057774258.1`	Pfam	`PF02875`	Mur_ligase_C	Domain	385	447	1.1e-06	30.2	Mur ligase, glutamate ligase domain
`XP_057774259.1`	Pfam	`PF08245`	Mur_ligase_M	Domain	52	296	1.6e-13	51.8	Mur ligase middle domain
`XP_057774259.1`	Pfam	`PF02875`	Mur_ligase_C	Domain	340	402	9.8e-07	30.4	Mur ligase, glutamate ligase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918275.1
TTACTTGCATCAGTCGGCTCATCCGCCAAATCGACTCGAATCTCTTGATGTGGGTGCTCTTAAAACGAGCCTCAGCCTACCCAAACACGCTCTTAAATTATTATAGACGAACAATTTAAGTTTGAATATGGATTGGTGGGATATAATATAAAGAGCAAGAGAGAAGTTGGAAATGGTTGATTCGTAGTACCGAACTTCCGTCACTCGCTCACACTCTTCCTTCTCAGTCTTTCACTTAAATTCATACAATTTGCTTGAAA...

XM_057918276.1
AAATCGACTCGAATCTCTTGATGTGGGTGCTCTTAAAACGAGCCTCAGCCTACCCAAACACGCTCTTAAATTATTATAGACGAACAATTTAAGTTTGAATATGGATTGGTGGGATATAATATAAAGAGCAAGAGAGAAGTTGGAAATGGGCATTGCTCTGCGCTCCGTGCCGCCGTCTTTCTACTGCGTCAACAGAGGTTCCGGAAATGGATGCATTCATGGAAAAACTCAACGACTACGAAAAAATCGGTGTTCCTAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993398
ATGAAAGTCCCAATTATTGCTTGTCGTCTCAATGCTCTCTTACTCGAACCATATAATCAACTTTTTGCTAAATCCAGGGCATTGCTCTGCGCTCCGTGCCGCCGTCTTTCTACTGCGTCAACAGAGGTTCCGGAAATGGATGCATTCATGGAAAAACTCAACGACTACGAAAAAATCGGTGTTCCTAAGGGAGCCGGTACTGATTCCTGCGACGGTTTCGATTTAGGTAGGATGCGGCGGCTGCTGCACAATCTTGGCAA...

LOC130993398
ATGGATGCATTCATGGAAAAACTCAACGACTACGAAAAAATCGGTGTTCCTAAGGGAGCCGGTACTGATTCCTGCGACGGTTTCGATTTAGGTAGGATGCGGCGGCTGCTGCACAATCTTGGCAATCCTCAATCCAAATTCAAGGCTATACATATTGCTGGTACAAAAGGGAAAGGATCAACTGCTGCTTTCCTTTCCAGCATTTTACGTGCGGAAGGGTATTCTGTTGGTTGCTATACTAGTCCGCACATACGCACTAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057774258.1
MKVPIIACRLNALLLEPYNQLFAKSRALLCAPCRRLSTASTEVPEMDAFMEKLNDYEKIGVPKGAGTDSCDGFDLGRMRRLLHNLGNPQSKFKAIHIAGTKGKGSTAAFLSSILRAEGYSVGCYTSPHIRTIRERITLGTSGEAVSGISLDSHFHKIKEELERAVEREKGHLSQFEVFTAIALSLFAEERVQFAVVEAGLGGARDATNVFTVSDLAAAVITNIGEEHLAALGGSLESIAVAKSGIIKEQRPLVLGGPFLP...

XP_057774259.1
MDAFMEKLNDYEKIGVPKGAGTDSCDGFDLGRMRRLLHNLGNPQSKFKAIHIAGTKGKGSTAAFLSSILRAEGYSVGCYTSPHIRTIRERITLGTSGEAVSGISLDSHFHKIKEELERAVEREKGHLSQFEVFTAIALSLFAEERVQFAVVEAGLGGARDATNVFTVSDLAAAVITNIGEEHLAALGGSLESIAVAKSGIIKEQRPLVLGGPFLPHIESMIREKALSLCSPVISASDPGNRSVLKGFTGACQVPRQLCDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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