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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002345`

染色体: Chr07 坐标: 21789939-21867619 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002345`
名称	SmilChr07G002345
描述	protein SGT1 homolog
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21789939 - 21867619 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993427`
GeneID	`130993427`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993427`
原始查询	`LOC130993427`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SGT1 homolog
产物	protein SGT1 homolog
Arabidopsis	`AT4G11260` (SGT1B) phosphatase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826728] identity=63.1; qcov=0.992; evalue=1.63e-155; confidence=high
Rice	`Os01g0624500` (OsSgt1) - identity=65.5; qcov=1.04; evalue=1.55e-159; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0050821 (protein stabilization); GO:0050832 (defense response to fungus); GO:0051087 (protein-folding chaperone binding)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04969 (CS); PF05002 (SGS); PF13181 (TPR_8); PF13431 (TPR_17)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993427

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774291.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057774291.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057774291.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057774291.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774291.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21790446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr7:21790803`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	30	A20,A25,B101,B138,B15,B31,B36,B50,B63,B7,B70,B91,C13,C15,C21,C37,C51,C55,C57,C59,C62,C64,C65,C66,C67,C76,C80,C83,C86,D5
`Chr7:21790805`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	28	A20,A25,B101,B138,B15,B31,B36,B50,B63,B7,B70,B91,C13,C15,C21,C37,C51,C55,C57,C62,C64,C65,C67,C76,C80,C83,C86,D5
`Chr7:21790808`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	31	A20,A25,B101,B11,B138,B15,B31,B36,B50,B63,B7,B70,B91,C13,C15,C21,C35,C37,C51,C55,C56,C57,C62,C64,C65,C67,C76,C80,C83,C86,D5
`Chr7:21790830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,C11,C69
`Chr7:21791646`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C37
`Chr7:21791783`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B50
`Chr7:21791783`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B50
`Chr7:21791784`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A16,A19,A22,B132,B137,B24,B37,B38,B39,B4,B42,B49,B75,B82,C1,C15,C22,C31,C38,C47,C48,C6,C63,C66,C85,D7,D8
`Chr7:21791790`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A16,A19,A22,B132,B137,B24,B37,B38,B39,B4,B42,B49,B50,B75,B82,C1,C15,C22,C38,C47,C48,C6,C63,C66,C85,D7,D8
`Chr7:21791792`	`A`	`ATG`	2bp_insertion	frameshift_variant	17	A11,B112,B134,B33,B47,B73,B79,B8,B87,C33,C37,C46,C50,C61,C65,C8,D10
`Chr7:21791793`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A11,B112,B134,B33,B47,B73,B79,B8,B87,C33,C37,C46,C50,C61,C65,C8,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774291.1

361 aa

180

361

TPR_8

TPR_17

TPR_8

SGS

PF13181 TPR_8 38-70 aa PF13431 TPR_17 61-91 aa PF13181 TPR_8 71-95 aa PF04969 CS 164-239 aa PF05002 SGS 280-359 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774291.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	38	70	9.6e-08	32.3	Tetratricopeptide repeat
`XP_057774291.1`	Pfam	`PF13431`	TPR_17	Repeat	61	91	7.8e-09	35.8	Tetratricopeptide repeat
`XP_057774291.1`	Pfam	`PF13181`	TPR_8	Repeat	71	95	9.6e-08	32.3	Tetratricopeptide repeat
`XP_057774291.1`	Pfam	`PF04969`	CS	Domain	164	239	1.5e-11	45.8	CS domain
`XP_057774291.1`	Pfam	`PF05002`	SGS	Domain	280	359	4e-36	123.7	SGS domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918308.1
TTTTTTTTTTTATCAAAAATTCCCTAAACTTAATTAACAAATATGAAAGGTAAAATTATTTTTATAATCGGAAAAGGTAACTACATCTAGAAGCTTCGTATTACCTTAAAAGTCTGTTTATACAAATACAAGTAGAAGTAGGTCTTGTGATTTTTTTATAAATAAATCAATCATTAATCATAGAGTCACAGTGCATCTAAATCTTGCTCTATCCTTCGTTCCCCTTTCCTGCAGTCTCCACTTTTCAATTTCAAGTCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993427
ATGGCGTCCGCGGATCTGGAGAAGAAGGCCAAAGAAGCGTTCATTGATGATCACTTTGAGCTAGCCGTTGACCTCTACTCTCAGGCGATTGCTTTGAGCCCTAACAGCGCTGACCTCTTCGTCGACCGCGCCCAGGCCAATATCAAACTCCAAAACTGCACCGAGGCTGTTGCTGATGCAAACAAAGCAATCGAGTTGGATCCTTCAAATGCGAAAGCATATCTGCGTAAAGGTGTGGCATGCATCAAGCTTGAGGAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774291.1
MASADLEKKAKEAFIDDHFELAVDLYSQAIALSPNSADLFVDRAQANIKLQNCTEAVADANKAIELDPSNAKAYLRKGVACIKLEEYQTAKTALEIGATLAPGDSRFKKLIEECDQYIAEEAQELPTQLAEKPSTGVVTPNNLPPAVELSSQEKAASSTRLKYRHEFYQKPEEVVVTIFAKGIPANYVVVDFGEQILSVTIEVPGEEAYHFQPRLFGKILPSKSKYEVMSTKIEIRLAKADAVHWTSLEFRRDVAVAQKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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