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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002349`

染色体: Chr07 坐标: 21813473-21814662 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002349`
名称	SmilChr07G002349
描述	protein SAR DEFICIENT 4
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21813473 - 21814662 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993428`
GeneID	`130993428`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993428`
原始查询	`LOC130993428`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SAR DEFICIENT 4
产物	protein SAR DEFICIENT 4
Arabidopsis	`AT5G52810` (AT5G52810) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835358] identity=54.5; qcov=0.936; evalue=4.86e-116; confidence=high
Rice	`Os10g0533200` - identity=50.1; qcov=0.977; evalue=2.63e-91; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF01488 (Shikimate_DH); PF02423 (OCD_Mu_crystall)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993428

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774292.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057774292.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057774292.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774292.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774292.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21813914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr7:21814244`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B74
`Chr7:21814244`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B74
`Chr7:21814481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B140
`Chr7:21814519`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A10
`Chr7:21814519`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774292.1

343 aa

172

343

OCD_Mu_crystall

Shikimate_DH

PF02423 OCD_Mu_crystall 26-333 aa PF01488 Shikimate_DH 137-237 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774292.1`	Pfam	`PF02423`	OCD_Mu_crystall	Family	26	333	1.3e-50	172.9	Ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin family
`XP_057774292.1`	Pfam	`PF01488`	Shikimate_DH	Family	137	237	1.1e-08	35.9	Shikimate / quinate 5-dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918309.1
AACACTTGATTTATGTTAGAATAAGAATCGGGTCGGCAGACTTTGTAAATTCTAATCGAATCGCAATCCACCATTTCAACTTAAGCTTCCCTTCTCCTCCCATGGCGGCGGCGACCAACCTAGATCAAGTCAACCCAGCCGCCACAGCCGCAGCACCACCCGTCTTCATCTCCACCGCCACCCTACAGTCCCTCATCACCCACAAATCCCTCATCGGCCACCTCGAATCCACCCTCCCGCCGCTCTCCGCCGCCATCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993428
ATGGCGGCGGCGACCAACCTAGATCAAGTCAACCCAGCCGCCACAGCCGCAGCACCACCCGTCTTCATCTCCACCGCCACCCTACAGTCCCTCATCACCCACAAATCCCTCATCGGCCACCTCGAATCCACCCTCCCGCCGCTCTCCGCCGCCATCCACTCCCCCCTCCGCCACGCCCACCAAATCACCCCCAATTCATCCTTCCTCCTCATGCCGTCCTGGTCCACCTCGCCACTCCTCCCTTACATCGGCACCAAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774292.1
MAAATNLDQVNPAATAAAPPVFISTATLQSLITHKSLIGHLESTLPPLSAAIHSPLRHAHQITPNSSFLLMPSWSTSPLLPYIGTKLVTHNSSNSALNLPGVHAIFVLFNSLTGQPLASMDATALTLYRTACVSALASSYLSREDAEILVMVGAGSLAPHLIKAHLAVRSKLKRVIVWNRTVEKARNLVDRLKEESGFEGVCFEADECLTAAVRMGDVISCATNSEVALVKGAELKAGAHLDLVGSFTPRMKECDDEAMR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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