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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002352`

染色体: Chr07 坐标: 21835252-21838471 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002352`
名称	SmilChr07G002352
描述	40S ribosomal protein S10-1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21835252 - 21838471 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993430`
GeneID	`130993430`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993430`
原始查询	`LOC130993430`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S10-1-like
产物	40S ribosomal protein S10-1-like
Arabidopsis	`AT4G25740` (AT4G25740) RNA binding Plectin/S10 domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828679] identity=85.9; qcov=0.872; evalue=9.26e-86; confidence=high
Rice	`Os02g0549600` (RPS10a) - identity=84.9; qcov=0.888; evalue=5.49e-85; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03501 (S10_plectin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993430

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774295.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057774295.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057774295.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057774295.1`
5	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057774295.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21836036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B124,B17,B65,C25
`Chr7:21836263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B27,C43
`Chr7:21836348`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B83
`Chr7:21836348`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B83
`Chr7:21836364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr7:21836369`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	227	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A21,A22,A23,A24,A25,A4,A5,A7,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B111,B112,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B34,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B68,B69,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C10,C11,C13,C15,C16,C17,C18,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C39,C4,C40,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D3,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr7:21836517`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774295.1

179 aa

179

S10_plectin

PF03501 S10_plectin 3-94 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774295.1`	Pfam	`PF03501`	S10_plectin	Domain	3	94	3.6e-43	146.3	Plectin/S10 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918312.1
TAAGTCAATGGAATAACGAATACACCTAGATTTGTATGGATTTTAAAAAGTCTTGAACCAATACACCAAGACTTTTAAAATCCATAGAAATCCATCAAATTCCACAACGAATATATTCCCTTTAACCTTGCACACACACCACATACAAATGCCATATATTCGCCATCTCTATCTACAACATAAACACCACTATACCCCCAATTGCGGCAACGCCTCCGCCACGCTCTCCTCCGCCTCCCGGTGAACCCTCATTCACCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993430
ATGATTATTTCGGAGAAGAACAGGAGAGAGATCTCCAAGTACCTCTTTCAAGAGGGCGTGTGCTATGCGAAGAAGGATTTCAACCTAGCTAAGCACCCCGAGATCGATGTCCCAAATCTGCAGGTGATTAAGCTTATGCAGAGCTTCAAGTCGAAAGAGTACGTGCGTGAGACCTTTGCTTGGATGCACTACTATTGGTATCTGACAAATGATGGAATTGAATTCCTCCGCACATACCTCAACCTTCCATCAGAGATCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774295.1
MIISEKNRREISKYLFQEGVCYAKKDFNLAKHPEIDVPNLQVIKLMQSFKSKEYVRETFAWMHYYWYLTNDGIEFLRTYLNLPSEIVPATLKKSAKPLGRPMGGPPGDRPRGPPRFDGDRPRFGDRDGYRGGQRGPPGEFGGEKGGAPADFQPSFRGGNGGGRPGFGRGAGGFGGSPSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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