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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002357`

染色体: Chr07 坐标: 21905161-21911188 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002357`
名称	SmilChr07G002357
描述	uncharacterized SmilChr07G002357
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	21905161 - 21911188 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993435`
GeneID	`130993435`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993435`
原始查询	`LOC130993435`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766708]; symbol=AT1G12244; hit=AT1G12244; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766708]; symbol=AT1G12244; hit=AT1G12244; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G12244` (AT1G12244) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766708] identity=65.8; qcov=0.65; evalue=1.65e-77; confidence=high
Rice	`Os10g0555200` - identity=64.1; qcov=0.525; evalue=2.32e-65; confidence=medium
GO	GO:0000967 (rRNA 5'-end processing)
KEGG	-
Pfam	PF03652 (RuvX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993435

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057774297.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057774297.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774297.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774297.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774297.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:21906913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr7:21906917`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:21906971`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A23,B1,B101,B126,B139,B5,B59,B77,B79,B80,B90,C27,C31,C35,C64,C75
`Chr7:21906980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B139,B80,C46
`Chr7:21906981`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B139,B80,C46
`Chr7:21906983`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A23,B101,B139,B71,B74,B80,C46,C75
`Chr7:21906989`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B139,B71,B74,B80,C75
`Chr7:21906989`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B139,B71,B74,B80,C75
`Chr7:21908034`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,C44,C5
`Chr7:21908074`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:21908081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,C44
`Chr7:21908109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B101,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774297.1

297 aa

148

297

RuvX

PF03652 RuvX 124-252 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774297.1`	Pfam	`PF03652`	RuvX	Family	124	252	2.5e-24	86.9	Holliday junction resolvase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918314.1
CATTCACACTGCACAGCAGATTTCGGCCGCATCTGCCTAAGCAGCGCCAGCTTTGTGTCTCTCCCACATTCCAGCCACCGGCGCCGCTGCCCCCCGTGCTCAGCCTGCAGGCCGCAGCCCCCTCTCCAGCGGCCTGAATCTGACCCAGGCAGAACGACTTTCCGGTGGCCTGAAGTTATGCAGACCTCAGCTATCGTATTCAACACAAAACCAATTTTAGGATGTATTCATGTGAGGCCCAGCAGTAGTTGTAGCCATAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993435
ATGCAGACCTCAGCTATCGTATTCAACACAAAACCAATTTTAGGATGTATTCATGTGAGGCCCAGCAGTAGTTGTAGCCATAGTAAAGGAAGCACTAATTCTGCTCAGTTTCCAGCCAAATTTAATCGGCCGCCACTGAAGGGTTGTGGTAGGCGCTTGTGTTCCGTTAGCAATAAGGTAAGAAAAGTTGAAGTTCCACTCCGCTATCTTATTCTGACTATAAAAGTCCCTCCTATCAGAAACTCAATTTCTCCATGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774297.1
MQTSAIVFNTKPILGCIHVRPSSSCSHSKGSTNSAQFPAKFNRPPLKGCGRRLCSVSNKVRKVEVPLRYLILTIKVPPIRNSISPCRGVQLSVAAPESVAWEEQIPLNTVRRKHDPSWRGGFSLGVDLGLSRTGVAISKGFIVRPLTVLKLRGQKLELRLLDLAEKQEVDEFIIGLPKSSEGKETEQSNKVRSVAGRFAVRAAERGWRVYLQDEHGTSSEALDHMIATGVSKSVREGKLDAYAAVKILERYFCESGKGIE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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