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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002376`

染色体: Chr07 坐标: 22118335-22120944 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002376`
名称	SmilChr07G002376
描述	rRNA 2'-O-methyltransferase fibrillarin 1-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22118335 - 22120944 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993457`
GeneID	`130993457`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993457`
原始查询	`LOC130993457`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rRNA 2'-O-methyltransferase fibrillarin 1-like
产物	rRNA 2'-O-methyltransferase fibrillarin 1-like
Arabidopsis	`AT4G25630` (FIB2) fibrillarin 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828668] identity=93.8; qcov=0.765; evalue=5.18e-171; confidence=high
Rice	`Os02g0821800` (OsMed18_1) - identity=90.1; qcov=0.759; evalue=7.46e-167; confidence=high
GO	GO:0000494 (box C/D sno(s)RNA 3'-end processing); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005730 (nucleolus); GO:0008649 (rRNA methyltransferase activity); GO:0031167 (rRNA methylation); GO:0031428 (box C/D methylation guide snoRNP complex); GO:0032040 (small-subunit processome); GO:1990258 (GO:1990258); GO:1990259 (histone H2AQ104 methyltransferase activity)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01269 (Fibrillarin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993457

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774340.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057774340.1`
3	Nucleolus rim	Nucleolus rim	0.60000	`XP_057774340.1`
4	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057774340.1`
5	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057774340.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22118673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C6,C84
`Chr7:22120052`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C84
`Chr7:22120357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr7:22120506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B137,C41,C74
`Chr7:22120585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774340.1

319 aa

160

319

Fibrillarin

PF01269 Fibrillarin 83-310 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774340.1`	Pfam	`PF01269`	Fibrillarin	Domain	83	310	5.6e-110	366.6	Fibrillarin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918357.1
CATTTTCCATAAACCCTAAAATAACCCGAAACCCTAGTAACATATCTTGACATTTCTCTATAAATTGAAGTTCCATAGGCCCCCACTCTGATAAACCCTAATATTGTTGCTCTCATACTATCTGAAGCGCCGTAGTAGCAATCATGGTTGCAACCACACCAACCCGAGGAGGACGCGGTGGCTTTAGGGGCGGCCGAGGAGATGGCGGCGGGAGAAGTGGCGGACGTGGTAGAGGCGGAGGTAGAGGCGGCGACTTCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993457
ATGGTTGCAACCACACCAACCCGAGGAGGACGCGGTGGCTTTAGGGGCGGCCGAGGAGATGGCGGCGGGAGAAGTGGCGGACGTGGTAGAGGCGGAGGTAGAGGCGGCGACTTCGGCGGCAGAAGTAGCGGAATGAAGAGAGGCGGTGGTAGAGGCAGTGGTAGAGGCGGCGACAGAGGCCGCGGTCGAGGAGGCCCCAGAGGTGGTGGCAGGGGAGGACCGATGAAGGGAGGAAGCAAGGTGGTTGTCGAGCCACACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774340.1
MVATTPTRGGRGGFRGGRGDGGGRSGGRGRGGGRGGDFGGRSSGMKRGGGRGSGRGGDRGRGRGGPRGGGRGGPMKGGSKVVVEPHRHDGVFIAKGKEDALCTKNLVPGEAVYNEKRVSVQNEDGTKVEYRVWNPFRSKLAAAILGGVDNIWIKPGARVLYLGAASGTTVSHVSDLVGPEGVVYAVEFSHRSGRDLVNMAKKRTNVIPIIEDARHPAKYRMLVGMVDVIFSDVAQPDQARILALNASYFLKAGGHFVISI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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