当前解析结果
SmilChr07G002379| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002379 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002379 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002379 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 22164268 - 22168845 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993460 |
|---|---|
| GeneID | 130993460 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993460 |
| 原始查询 | LOC130993460 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF02902 (Peptidase_C48); PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993460 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057774341.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.60000 | XP_057774341.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057774341.1 |
| 4 | PML body | PML body | 0.20000 | XP_057774341.1 |
| 5 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057774341.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057774341.1PF29561
DUF8566 59-236 aa
PF09331
DUF1985 81-215 aa
PF02902
Peptidase_C48 836-976 aa
XP_057774342.1PF29561
DUF8566 59-236 aa
PF09331
DUF1985 81-215 aa
PF02902
Peptidase_C48 832-972 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057774341.1 |
Pfam | PF29561 |
DUF8566 | Domain | 59 | 236 | 3.1e-08 | 34.4 | Domain of unknown function (DUF8566) |
XP_057774341.1 |
Pfam | PF09331 |
DUF1985 | Family | 81 | 215 | 2.1e-11 | 44.7 | Domain of unknown function (DUF1985) |
XP_057774341.1 |
Pfam | PF02902 |
Peptidase_C48 | Domain | 836 | 976 | 1.6e-05 | 25.6 | Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain |
XP_057774342.1 |
Pfam | PF29561 |
DUF8566 | Domain | 59 | 236 | 3.1e-08 | 34.4 | Domain of unknown function (DUF8566) |
XP_057774342.1 |
Pfam | PF09331 |
DUF1985 | Family | 81 | 215 | 2.1e-11 | 44.7 | Domain of unknown function (DUF1985) |
XP_057774342.1 |
Pfam | PF02902 |
Peptidase_C48 | Domain | 832 | 972 | 1.5e-05 | 25.6 | Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。