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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002383`

染色体: Chr07 坐标: 22224020-22229474 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002383`
名称	SmilChr07G002383
描述	mitogen-activated protein kinase kinase kinase YODA-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22224020 - 22229474 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993464`
GeneID	`130993464`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993464`
原始查询	`LOC130993464`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitogen-activated protein kinase kinase kinase YODA-like
产物	mitogen-activated protein kinase kinase kinase YODA-like
Arabidopsis	`AT1G63700` (YDA) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842674] identity=58; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0559800` (YDA1) - identity=58.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF03109 (ABC1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993464

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774343.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057774343.1`
3	Cell junction	细胞连接	0.20000	`XP_057774343.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057774343.1`
5	Dendrite	Dendrite	0.20000	`XP_057774343.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22224389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:22224461`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr7:22224760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B101,C32,C68
`Chr7:22224924`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	22	A11,A15,A24,B118,B4,B77,B83,C11,C13,C14,C18,C3,C34,C49,C52,C54,C56,C59,C67,C69,C7,C81
`Chr7:22225076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr7:22226419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B126,B98,C33,C48
`Chr7:22226885`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A6,B13,B135,C23,C38
`Chr7:22226885`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A6,B13,B135,C23,C38
`Chr7:22226949`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A25,B11,B12,B120,B129,B13,B135,B138,B15,B56,B57,B79,C12,C23,C49,C5,C56,C59,C72
`Chr7:22226951`	`G`	`GA`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	19	A25,B11,B12,B120,B129,B13,B135,B138,B15,B56,B57,B79,C12,C23,C49,C5,C56,C59,C72
`Chr7:22226952`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	A25,B11,B12,B120,B129,B13,B135,B138,B15,B56,B57,B79,C12,C23,C49,C5,C56,C59,C72
`Chr7:22227115`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	126	A11,A15,A18,A2,A20,A21,A25,A3,A4,A5,A7,B1,B100,B101,B104,B108,B11,B111,B112,B113,B114,B115,B118,B12,B120,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B140,B16,B17,B19,B25,B26,B27,B29,B30,B31,B35,B36,B37,B42,B43,B47,B48,B49,B53,B55,B66,B68,B69,B7,B70,B71,B76,B78,B8,B80,B81,B85,B89,B92,B94,B95,B98,B99,C10,C12,C18,C19,C20,C23,C24,C25,C29,C3,C32,C33,C34,C36,C37,C41,C42,C45,C46,C48,C49,C54,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C65,C67,C68,C70,C72,C73,C74,C75,C80,C81,C85,C86,C87,D1,D10,D11,D3,D5,D6,D7,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774343.1

887 aa

444

887

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

ABC1

PF00069 Pkinase 411-666 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 412-662 aa PF03109 ABC1 453-561 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774343.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	411	666	2.3e-71	241.0	Protein kinase domain
`XP_057774343.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	412	662	5.6e-47	160.9	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057774343.1`	Pfam	`PF03109`	ABC1	Domain	453	561	1.5e-05	25.0	ABC1 atypical kinase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918360.1
AAAATATGCCTTCATGGTGGGGAAAGTCATCGTCAAAAGAGGCAAAAAAGAAAACAACCAAGGAAAGTTTTATCGACACATTTCATAAGAAGTTCAAAAGTCCTGAAAGTAAATCTTCTGGTAGATCAGCAGGGTCTAGAAGACGTTCAAGTGACACTGTTTCAGAAAGAGGGTCTCAGTCACGTGCTCCGTCAAGGTCTCCATCACCTTCCAAGAATGTAGCACGATGTCAAAGTTTTGTGGAAAGGCCTCAATCACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993464
ATGCCTTCATGGTGGGGAAAGTCATCGTCAAAAGAGGCAAAAAAGAAAACAACCAAGGAAAGTTTTATCGACACATTTCATAAGAAGTTCAAAAGTCCTGAAAGTAAATCTTCTGGTAGATCAGCAGGGTCTAGAAGACGTTCAAGTGACACTGTTTCAGAAAGAGGGTCTCAGTCACGTGCTCCGTCAAGGTCTCCATCACCTTCCAAGAATGTAGCACGATGTCAAAGTTTTGTGGAAAGGCCTCAATCACAGCCACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774343.1
MPSWWGKSSSKEAKKKTTKESFIDTFHKKFKSPESKSSGRSAGSRRRSSDTVSERGSQSRAPSRSPSPSKNVARCQSFVERPQSQPLPVPGIRLANVSRTDSGISETAKPKPERVSKPSLFLPLPRPACIRQRLEPAELDAELAVASVCSECSIESDDPVDSRQRSPLANDYDIGCRTAAGSPSSISLKDQPPVAPIISKVAPVPVNLFSNKHLNSSPPRRRHLNGHMANLQVPPHGAFSSAPDSSRSSPSRSPMRASGY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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