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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002387`

染色体: Chr07 坐标: 22267880-22269047 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002387`
名称	SmilChr07G002387
描述	gibberellin 20-oxidase-like protein
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22267880 - 22269047 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993468`
GeneID	`130993468`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993468`
原始查询	`LOC130993468`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	gibberellin 20-oxidase-like protein
产物	gibberellin 20-oxidase-like protein
Arabidopsis	`AT5G51310` (AT5G51310) 2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835205] identity=54.9; qcov=1.03; evalue=5.91e-127; confidence=high
Rice	`Os04g0643500` - identity=29.5; qcov=0.914; evalue=9.48e-35; confidence=low
GO	GO:0051213 (dioxygenase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03171 (2OG-FeII_Oxy); PF14226 (DIOX_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993468

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057774346.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057774346.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057774346.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774346.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774346.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22267943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:22268141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr7:22268446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr7:22268545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr7:22268590`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	98	A13,A14,A18,A19,A2,A20,A21,A6,A7,A9,B10,B101,B103,B105,B107,B108,B109,B114,B119,B122,B124,B129,B13,B130,B131,B132,B136,B139,B14,B140,B2,B22,B24,B32,B33,B37,B42,B43,B44,B47,B5,B53,B56,B58,B59,B61,B62,B65,B67,B70,B73,B75,B76,B77,B78,B8,B81,B82,B91,B93,B96,C1,C10,C12,C14,C15,C18,C2,C21,C22,C3,C32,C34,C40,C44,C45,C47,C48,C5,C55,C60,C65,C68,C7,C70,C71,C72,C77,C82,C83,C84,C86,D10,D11,D2,D4,D6,D7
`Chr7:22268594`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	97	A13,A14,A18,A19,A2,A20,A21,A6,A9,B10,B101,B103,B105,B107,B108,B109,B114,B119,B122,B124,B129,B13,B130,B131,B132,B136,B139,B14,B140,B2,B22,B24,B32,B33,B37,B42,B43,B44,B47,B5,B53,B56,B58,B59,B61,B62,B65,B67,B70,B73,B75,B76,B77,B78,B8,B81,B82,B91,B93,B96,C1,C10,C12,C14,C15,C18,C2,C21,C22,C3,C32,C34,C40,C44,C45,C47,C48,C5,C55,C60,C65,C68,C7,C70,C71,C72,C77,C82,C83,C84,C86,D10,D11,D2,D4,D6,D7
`Chr7:22268806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr7:22268809`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	17	A19,A22,B12,B20,B28,B47,B65,C12,C24,C33,C45,C46,C49,C59,C77,C9,D5
`Chr7:22268818`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:22268819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:22268857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr7:22268977`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B12,B26,B55,B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774346.1

315 aa

158

315

DIOX_N

2OG-FeII_Oxy

PF14226 DIOX_N 5-78 aa PF03171 2OG-FeII_Oxy 160-259 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774346.1`	Pfam	`PF14226`	DIOX_N	Family	5	78	4.6e-17	63.5	non-haem dioxygenase in morphine synthesis N-terminal
`XP_057774346.1`	Pfam	`PF03171`	2OG-FeII_Oxy	Domain	160	259	1.6e-25	90.0	2OG-Fe(II) oxygenase superfamily

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918363.1
ATGTCTGTACACCTTCCTATCTTCGACATCTCACAGCCCCTTAGCTCATCCTCTCTCTCCTCCCTCTCTCTAGCCTGCAGAGAATGGGGATTTTTCCACATCACCAACCATGGAATTCCCAAAGAGTTAATGAAGAAACTGCATTCTTCATCTACCCAGATTTTCAACCTCCCTTCAGAGGTGAAGCACAAAGCAGGCCCTTCATCAGCTGTGAAAACATACACTCCCCATTTCATCGCCTCCCCCTTCTTCGAGAGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993468
ATGTCTGTACACCTTCCTATCTTCGACATCTCACAGCCCCTTAGCTCATCCTCTCTCTCCTCCCTCTCTCTAGCCTGCAGAGAATGGGGATTTTTCCACATCACCAACCATGGAATTCCCAAAGAGTTAATGAAGAAACTGCATTCTTCATCTACCCAGATTTTCAACCTCCCTTCAGAGGTGAAGCACAAAGCAGGCCCTTCATCAGCTGTGAAAACATACACTCCCCATTTCATCGCCTCCCCCTTCTTCGAGAGCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774346.1
MSVHLPIFDISQPLSSSSLSSLSLACREWGFFHITNHGIPKELMKKLHSSSTQIFNLPSEVKHKAGPSSAVKTYTPHFIASPFFESLRVSGPDFFASAHTSCQAFLRHPTHEFSEIVKEYGSRMSKLSKRVIEMVMECMGANYGMKFLPEFKKCHGYLRMNNYSSPCCIDEEEEEEEVEGLGMHTDMSCITVVYQDDTGGLQVRSREGRWMDIAPRQDTLVVNIGDLMQAWSNGELLSSQHRVVLRRNVNRFSVAFFWCF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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