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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002392`

染色体: Chr07 坐标: 22298087-22301851 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002392`
名称	SmilChr07G002392
描述	signal peptide peptidase-like 1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22298087 - 22301851 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993475`
GeneID	`130993475`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993475`
原始查询	`LOC130993475`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	signal peptide peptidase-like 1
产物	signal peptide peptidase-like 1
Arabidopsis	`AT4G33410` (SPPL1) SIGNAL PEPTIDE PEPTIDASE-LIKE 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829478] identity=76.6; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0393100` (SPPL1) - identity=72.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006465 (GO:0006465); GO:0030660 (Golgi-associated vesicle membrane); GO:0033619 (membrane protein proteolysis); GO:0042500 (aspartic endopeptidase activity, intramembrane cleaving); GO:0098553 (lumenal side of endoplasmic reticulum membrane); GO:0098554 (cytoplasmic side of endoplasmic reticulum membrane)
KEGG	-
Pfam	PF04258 (Peptidase_A22B)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993475

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057774354.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057774354.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057774354.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774354.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774354.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22299058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:22299115`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:22299241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:22299432`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C84
`Chr7:22299545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr7:22301176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr7:22301534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B104,B32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774354.1

371 aa

186

371

Peptidase_A22B

PF04258 Peptidase_A22B 49-358 aa

XP_057774355.1

371 aa

186

371

Peptidase_A22B

PF04258 Peptidase_A22B 49-358 aa

XP_057774356.1

371 aa

186

371

Peptidase_A22B

PF04258 Peptidase_A22B 49-358 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774354.1`	Pfam	`PF04258`	Peptidase_A22B	Family	49	358	1.5e-78	265.1	Signal peptide peptidase
`XP_057774355.1`	Pfam	`PF04258`	Peptidase_A22B	Family	49	358	1.5e-78	265.1	Signal peptide peptidase
`XP_057774356.1`	Pfam	`PF04258`	Peptidase_A22B	Family	49	358	1.5e-78	265.1	Signal peptide peptidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918373.1
GACCAAATGTTAATATCATAACTCTTAAGGGACCAAATTACTATATTTCCTATATAGTTAGTGGGGTAGAAGTGAAAATACCGAAATACGGCCGGCTGCTCCTGCCTGCGTCGGTCTCACTCTCTCAAGTCTCTCTCCACTTCACTTTTCTCTCTGAACGCTCCCCCGTCAGAGAAGCCCCTTTTCGCATCCCAAAAATTTGGCAAATGGTCCGGGGGTGTTGTTCAGATCAGATGTCAACATAGATTCTTGATTACCTG...

XM_057918371.1
AAAAATTTGGCAAATGGTAATTCTATTTCTTGAATGGCCCTTGTTGTATTTGACCAAGCAATATTTTCCTCTCAGTTCTTCTATAGAATAATCGTTATCTTGATTTTGTTTGGATTAATGTCTACTTTTGTTTAATTATATATTTTTTTCTTTGTTGTCTACTATATTCACCATTGAGTGTTTAGTCAACCCGTCTGATAACTTTTCCGTGTTTCCAGGTAGCTGATATTTAATACTTTCCCCTCTGCATTTTTATGTAC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130993475
ATGGAGCCTCTTTGGAAGCTTGCATATTTACTTGAACCGTCTTCACTCACCCTCTTTGTCACAGCCATAGTAGTGTCATATGCATCTGCTTCTAGAGCTCTGAATTACGGAAAGGAAATGGAGCGGAACCGTGATTTATCTGAAGCTTCCATTACTCTAGATAGCTCTCAGGCATTGATGATACCGATAATGAGCTCGTGCAGCTTGCTCTTTATGTTCTATCTGTTTTCTTCCGTCTCTCAACTTCTGACTGCTTTTAC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057774354.1
MEPLWKLAYLLEPSSLTLFVTAIVVSYASASRALNYGKEMERNRDLSEASITLDSSQALMIPIMSSCSLLFMFYLFSSVSQLLTAFTAIASASALYFCLTPYTAQVKSHFGLPDPYVSRCCAKSFTRIQSILLLVCVALVVAWLVTGHWILNNLLGISLCIAFVSHVRLPNIKICAMLLACLFVYDVFWVFYSERFFGANVMVSVATQQASNPVHTVANSLNLPGLQLITRKLELPVKIVFPRNMLGSAVPGNNTSDYMM...

XP_057774355.1
MEPLWKLAYLLEPSSLTLFVTAIVVSYASASRALNYGKEMERNRDLSEASITLDSSQALMIPIMSSCSLLFMFYLFSSVSQLLTAFTAIASASALYFCLTPYTAQVKSHFGLPDPYVSRCCAKSFTRIQSILLLVCVALVVAWLVTGHWILNNLLGISLCIAFVSHVRLPNIKICAMLLACLFVYDVFWVFYSERFFGANVMVSVATQQASNPVHTVANSLNLPGLQLITRKLELPVKIVFPRNMLGSAVPGNNTSDYMM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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