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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002402`

染色体: Chr07 坐标: 22378229-22379275 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002402`
名称	SmilChr07G002402
描述	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 31
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22378229 - 22379275 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993484`
GeneID	`130993484`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993484`
原始查询	`LOC130993484`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 31
产物	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 31
Arabidopsis	`AT3G48970` (AT3G48970) Heavy metal transport/detoxification superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824058] identity=72.8; qcov=1.01; evalue=1.53e-55; confidence=high
Rice	`Os03g0156600` - identity=41; qcov=1.03; evalue=2.05e-24; confidence=medium
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00403 (HMA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993484

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057774368.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057774368.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057774368.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057774368.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774368.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22378590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,B33
`Chr7:22378769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr7:22378780`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A23,B36,C65,C7
`Chr7:22378780`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A23,B36,C65,C7
`Chr7:22378838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C57,C86
`Chr7:22378861`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	71	A1,A10,A14,A15,A16,A20,A25,B10,B103,B105,B11,B113,B114,B12,B121,B125,B126,B127,B130,B132,B15,B16,B18,B25,B26,B27,B29,B3,B37,B4,B41,B44,B45,B47,B5,B50,B51,B55,B58,B7,B72,B73,B74,B81,B85,B87,B90,B92,C1,C10,C25,C27,C29,C39,C40,C41,C43,C46,C47,C53,C55,C57,C72,C74,C76,C79,C80,C86,C87,D7,D8
`Chr7:22379008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C19,D11
`Chr7:22379011`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	37	A18,A20,B103,B105,B11,B113,B114,B12,B127,B132,B15,B27,B29,B37,B41,B44,B47,B51,B55,B7,B70,B81,B85,B87,B90,B92,C10,C27,C41,C47,C55,C57,C72,C74,C86,D7,D8
`Chr7:22379024`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A25,A6,B10,B121,B125,B126,B130,B16,B18,B25,B26,B4,B45,B50,B72,B73,B74,C1,C29,C39,C40,C43,C46,C76,C86,C87,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774368.1

137 aa

137

HMA

PF00403 HMA 6-63 aa

XP_057774369.1

135 aa

135

HMA

PF00403 HMA 4-61 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774368.1`	Pfam	`PF00403`	HMA	Domain	6	63	2.4e-14	54.2	Heavy-metal-associated domain
`XP_057774369.1`	Pfam	`PF00403`	HMA	Domain	4	61	2.3e-14	54.2	Heavy-metal-associated domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918385.1
TATGAAGTTGGAGTAGGGTGTGTTGTGTTTGAAAAAGCGAGTCACGCTCTCCCACCCCCACGCCTGACCCCCTTCTCTGCTTTCTTGTCTCAATCTCCAATGCCATTCAATATTATGACCTGCCTCTCTTCTTCACTACCTTCCATCATCACCCCAAAACACTATACAGGCACAACTCTCCTTTTCAATTTTCTTTATATAACCAAATAATTATCATCAATCTTCCTCCACTTTTCAGTTTCATATCTATCTCAATATGT...

XM_057918386.1
CGCCTGACCCCCTTCTCTGCTTTCTTGTCTCAATCTCCAATGCCATTCAATATTATGACCTGCCTCTCTTCTTCACTACCTTCCATCATCACCCCAAAACACTATACAGGCACAACTCTCCTTTTCAATTTTCTTTATATAACCAAATAATTATCATCAATCTTCCTCCACTTTTCAGTTTCATATCTATCTCAATATATGTTGGAAGTGAGGGTTCCCAACTTGGATTGCGAGGGATGCGCTACCAAGGTTAGGAAAGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993484
ATGTCTATGTTGGAAGTGAGGGTTCCCAACTTGGATTGCGAGGGATGCGCTACCAAGGTTAGGAAAGCTGTACTGAAGCTGAAAGGTGTGGATGAGGTGGAAGTAGAGATGGAGGTGCAGAAAATAACGGTGAGGGGTTACGCATTGGAGGAGAAAAAGGTGCTCAAGGCCATTAAACGCGCGGGAAAGGCGGCGGAGCCATGGCCGTATCCCGGCTACTCATATTTTTCCTCATTTTACAAATACCCTTCTCACGTTAT...

LOC130993484
ATGTTGGAAGTGAGGGTTCCCAACTTGGATTGCGAGGGATGCGCTACCAAGGTTAGGAAAGCTGTACTGAAGCTGAAAGGTGTGGATGAGGTGGAAGTAGAGATGGAGGTGCAGAAAATAACGGTGAGGGGTTACGCATTGGAGGAGAAAAAGGTGCTCAAGGCCATTAAACGCGCGGGAAAGGCGGCGGAGCCATGGCCGTATCCCGGCTACTCATATTTTTCCTCATTTTACAAATACCCTTCTCACGTTATCAACCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057774368.1
MSMLEVRVPNLDCEGCATKVRKAVLKLKGVDEVEVEMEVQKITVRGYALEEKKVLKAIKRAGKAAEPWPYPGYSYFSSFYKYPSHVINHYYETSRNVAAPSVHTFFHTPAVYSVAVASDEAVASIFSDDNPHACSIM

XP_057774369.1
MLEVRVPNLDCEGCATKVRKAVLKLKGVDEVEVEMEVQKITVRGYALEEKKVLKAIKRAGKAAEPWPYPGYSYFSSFYKYPSHVINHYYETSRNVAAPSVHTFFHTPAVYSVAVASDEAVASIFSDDNPHACSIM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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