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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002409`

染色体: Chr07 坐标: 22444126-22445001 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002409`
名称	SmilChr07G002409
描述	transcription factor LAF1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22444126 - 22445001 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993490`
GeneID	`130993490`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993490`
原始查询	`LOC130993490`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor LAF1
产物	transcription factor LAF1
Arabidopsis	`AT5G52260` (MYB19) myb domain protein 19 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835302] identity=72.5; qcov=0.649; evalue=5.19e-54; confidence=high
Rice	`Os04g0532800` (R2R3-MYB) - identity=69.7; qcov=0.649; evalue=4.32e-56; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993490

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774378.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774378.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774378.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774378.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774378.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22444441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,D4
`Chr7:22444495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr7:22444565`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr7:22444951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774378.1

168 aa

168

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 5-52 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 8-67 aa PF00249 Myb_DNA-binding 58-103 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 61-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774378.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	5	52	3.5e-31	107.8	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057774378.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	8	67	1.4e-20	74.0	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057774378.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	58	103	3.5e-31	107.8	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057774378.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	61	109	1.4e-20	74.0	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918395.1
ACTAGACTCGGTTTGTGAAGTATTATCATATCGAGAGAATTGATGGGTAAGAGGAAAGGGTTATGGTCTCCAGACGAGGACGAGAGGCTGCGAAACTATATAGTGAAGCATGGGCATGGCTGCTGGACCTCCGTTGCTATAAATGCTGGTTTACAAAGGAATGGGAAGAGCTGCAGATTAAGGTGGATCAATTATTTAAGGCCAGGGCTGAAGCGCGGCGCCTTTAGCATGGCAGAGGAAGACACCATTTTCACCCTTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993490
ATGGGTAAGAGGAAAGGGTTATGGTCTCCAGACGAGGACGAGAGGCTGCGAAACTATATAGTGAAGCATGGGCATGGCTGCTGGACCTCCGTTGCTATAAATGCTGGTTTACAAAGGAATGGGAAGAGCTGCAGATTAAGGTGGATCAATTATTTAAGGCCAGGGCTGAAGCGCGGCGCCTTTAGCATGGCAGAGGAAGACACCATTTTCACCCTTCATAAAGTATTAGGCAACAAGTGGTCTCAGATAGCGCAGCATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774378.1
MGKRKGLWSPDEDERLRNYIVKHGHGCWTSVAINAGLQRNGKSCRLRWINYLRPGLKRGAFSMAEEDTIFTLHKVLGNKWSQIAQHLAGRSDNEIKNYWHSYLKKRVAKMEVDKSPNLSLPKLFFADWLCLDQDLGHTSNLEDHTCLFDDIHIPIHHFPPEFNTFSQP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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