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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002411`

染色体: Chr07 坐标: 22476000-22477411 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002411`
名称	SmilChr07G002411
描述	WD repeat-containing protein RUP2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22476000 - 22477411 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993492`
GeneID	`130993492`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993492`
原始查询	`LOC130993492`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WD repeat-containing protein RUP2
产物	WD repeat-containing protein RUP2
Arabidopsis	`AT5G23730` (RUP2) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832438] identity=60.8; qcov=0.925; evalue=3.65e-137; confidence=high
Rice	`Os02g0771100` (PPS) - identity=33; qcov=0.919; evalue=3.1e-54; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0010224 (response to UV-B)
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04712 (Circadian rhythm - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993492

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774381.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057774381.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057774381.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774381.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774381.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22476166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C1
`Chr7:22476196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B127,D9
`Chr7:22476218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr7:22476238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr7:22476245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr7:22476250`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr7:22476265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr7:22476268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr7:22476280`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,D9
`Chr7:22476354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr7:22476375`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	147	A1,A10,A14,A15,A18,A19,A2,A21,A25,A3,A7,B10,B104,B105,B106,B109,B11,B110,B111,B113,B115,B117,B119,B12,B124,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B138,B15,B16,B18,B21,B22,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B41,B43,B45,B46,B48,B49,B5,B52,B54,B55,B56,B57,B6,B64,B65,B68,B71,B72,B76,B77,B79,B80,B81,B82,B85,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C1,C12,C13,C14,C15,C17,C18,C2,C20,C25,C27,C28,C29,C3,C33,C34,C35,C36,C38,C4,C40,C41,C42,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C54,C55,C57,C59,C61,C63,C67,C68,C69,C7,C70,C75,C77,C78,C80,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D5,D6,D8,D9
`Chr7:22476379`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	149	A1,A10,A14,A15,A18,A19,A2,A21,A25,A3,A7,B10,B104,B105,B106,B109,B11,B110,B111,B113,B115,B117,B119,B12,B124,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B138,B15,B16,B17,B18,B21,B22,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B41,B43,B45,B46,B48,B49,B5,B52,B54,B55,B56,B57,B6,B64,B65,B68,B71,B72,B76,B77,B79,B80,B81,B82,B85,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C1,C12,C13,C14,C15,C17,C18,C2,C20,C25,C27,C28,C29,C3,C33,C34,C35,C36,C38,C4,C40,C41,C42,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C57,C59,C61,C63,C67,C68,C69,C7,C70,C74,C75,C77,C78,C80,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D5,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774381.1

359 aa

180

359

WD40

PF00400 WD40 132-168 aa PF00400 WD40 219-254 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774381.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	132	168	2e-21	76.2	WD domain, G-beta repeat
`XP_057774381.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	219	254	2e-21	76.2	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918398.1
ATACAAACCAAAAATCTCTTACTAGAAAAAATGGGGCTTCAGTTTTGTGAGTGAGAGTTGGGGAAAATGAAGAATTAAAAAGTGAGAGACGCATATAAAAAGGTGGAAAAACAAGTAATCTAGGACCATAAACGTAGTTATATTTTTGTAGGCATGGATAACACTTACCTTAGCCCGAGGGAAGATGGATCTGATTGGCTGAAAACCCCCTCAGCTCCACCAACCTCCACCGCCGCCTAGAAATTCACATGAATGGGATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993492
ATGAAAAACTCCTCCTTGGATTCCGCAGAAGAAACCGATCCCGCCAGCCACTGGGATTTCAACCTCTCCGCTGTAATCGCTTCCGCATCCGCCTCCGCCTCCGCCTCCGACGCCATCGGAGTCCTCGAATTCGACCACACCAACTCCCTCCTGGCCACCGGCGGCATCGCCAGGAAAATCAGAATCTACAACGCCCAAAAGTTTCCAATGTTGGAGGAGGGCGGCGGTGCGGCAACAGTGGTGGACCACGCGGCTGCATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774381.1
MKNSSLDSAEETDPASHWDFNLSAVIASASASASASDAIGVLEFDHTNSLLATGGIARKIRIYNAQKFPMLEEGGGAATVVDHAAACDYYMYTPAKLSSLKWKPGSGSRLIGSGDYDGVVMEYDLEKRVPVFERDEHGGRRVWSIDYSTGDPTLGASGSDDGTMQMWDTRCHAGTSLASVRPALSPVCCVEFNPFGGLTVAVGCADRKVYGYDARRMVEPVFVLEGHDKAVSYARFLDSQTIVSSSIDGSLMMWHAEERR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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