Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002419`

染色体: Chr07 坐标: 22534351-22538300 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002419`
名称	SmilChr07G002419
描述	protein phosphatase inhibitor 2
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22534351 - 22538300 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993504`
GeneID	`130993504`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993504`
原始查询	`LOC130993504`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein phosphatase inhibitor 2
产物	protein phosphatase inhibitor 2
Arabidopsis	`AT5G52200` (I-2) phosphoprotein phosphatase inhibitor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835296] identity=47.5; qcov=0.856; evalue=3.07e-25; confidence=medium
Rice	`Os05g0301600` - identity=61.9; qcov=0.869; evalue=5.29e-51; confidence=high
GO	GO:0004864 (protein phosphatase inhibitor activity); GO:0009966 (regulation of signal transduction); GO:0043666 (GO:0043666)
KEGG	-
Pfam	PF04979 (IPP-2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993504

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774393.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057774393.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057774394.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774393.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774393.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774393.1

163 aa

163

IPP-2

PF04979 IPP-2 4-139 aa

XP_057774394.1

160 aa

160

IPP-2

PF04979 IPP-2 4-136 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774393.1`	Pfam	`PF04979`	IPP-2	Family	4	139	1.2e-24	88.2	Protein phosphatase inhibitor 2 (IPP-2)
`XP_057774394.1`	Pfam	`PF04979`	IPP-2	Family	4	136	2.8e-25	90.2	Protein phosphatase inhibitor 2 (IPP-2)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918410.1
GGTGCATTTGTCATTTCGTAGGCAGCAGATAAATTCCGGATTCCTGATCCTGAACGCCAAAACGAAGAGGAGAGAGAGAGAGAGGCTCACAATTTTGTTTCCGTTTCGCAGCGAAGCATTGGAAATAACCCGAAAGGAAATCCATCGTATCATCAAATGTCACGAGTGAAATGGAATGAAGATAATTTAGCAGAAATTGAGGCAAATAAACCTGTAAGGCAGAAAATAACCGAACCAAAGACACCGTACCATCCCATGAT...

XM_057918411.1
GGTGCATTTGTCATTTCGTAGGCAGCAGATAAATTCCGGATTCCTGATCCTGAACGCCAAAACGAAGAGGAGAGAGAGAGAGAGGCTCACAATTTTGTTTCCGTTTCGCAGCGAAGCATTGGAAATAACCCGAAAGGAAATCCATCGTATCATCAAATGTCACGAGTGAAATGGAATGAAGATAATTTAGCAGAAATTGAGGCAAATAAACCTGTAAGGCAGAAAATAACCGAACCAAAGACACCGTACCATCCCATGAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993504
ATGTCACGAGTGAAATGGAATGAAGATAATTTAGCAGAAATTGAGGCAAATAAACCTGTAAGGCAGAAAATAACCGAACCAAAGACACCGTACCATCCCATGATTGATGATGAAGATGATGGTGATTCATCATCTCCTTCGAGAAGAGGAGGTTTTGGGGATTATTTTGAAGATGCAATGAATATACTAGCGACATCTTCTTCATTGAATGATGTAGGCTCCTCTAGTAAAACTGGCTCACATCACTCAGGCTGGACATC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057774393.1
MSRVKWNEDNLAEIEANKPVRQKITEPKTPYHPMIDDEDDGDSSSPSRRGGFGDYFEDAMNILATSSSLNDVGSSSKTGSHHSGWTSSDDDTDAMDQGEEDSDSERRRSFKEHRKDHYDEFLKIKELRRNGSQLEDESDDESSITAGVKDIDIKESSRPANGS

XP_057774394.1
MSRVKWNEDNLAEIEANKPVRQKITEPKTPYHPMIDDEDDGDSSSPSRRGGFGDYFEDAMNILATSSSLNDVGSSSKTGSHHSGWTSSDDDTDAMDQDSDSERRRSFKEHRKDHYDEFLKIKELRRNGSQLEDESDDESSITAGVKDIDIKESSRPANGS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器