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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002437`

染色体: Chr07 坐标: 22785283-22786216 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002437`
名称	SmilChr07G002437
描述	dehydration-responsive element-binding protein 1A-like
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	22785283 - 22786216 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993521`
GeneID	`130993521`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993521`
原始查询	`LOC130993521`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dehydration-responsive element-binding protein 1A-like
产物	dehydration-responsive element-binding protein 1A-like
Arabidopsis	`AT4G25470` (CBF2) C-repeat/DRE binding factor 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828651] identity=56.8; qcov=0.812; evalue=1.82e-66; confidence=high
Rice	`Os04g0572400` (OsDREB1E) - identity=51.4; qcov=0.756; evalue=2.58e-48; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00847 (AP2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993521

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774431.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774431.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774431.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774431.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057774431.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:22785426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B59,C22,C7,C84
`Chr7:22785483`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr7:22785549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B132,B81
`Chr7:22785580`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B60
`Chr7:22785580`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B60
`Chr7:22785588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr7:22785674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr7:22785679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr7:22785780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr7:22785873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774431.1

234 aa

117

234

AP2

PF00847 AP2 79-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774431.1`	Pfam	`PF00847`	AP2	Domain	79	128	2.2e-15	57.4	AP2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918448.1
TTGATATAAATACCACTCGTTCCCCAGAAATTAATTTATTGCGACAACTAAATCCACTCTCTAGTCTTCACTTGCAAAACTCAAACACTACTACTCCCTCACTCACTAATATATATATATGGATATGTTTGGAAGCTCCAACTCGGACCAGTATCCCGGTGTGCAAGATGTGTGGTCGCCCTCATCATCTTCCGAAGCAGCGGCGGAACCTGCTGTTTCTTCTTCCCACATTGGCAGCTCCGGAGCCGGCGCCGGCGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993521
ATGGATATGTTTGGAAGCTCCAACTCGGACCAGTATCCCGGTGTGCAAGATGTGTGGTCGCCCTCATCATCTTCCGAAGCAGCGGCGGAACCTGCTGTTTCTTCTTCCCACATTGGCAGCTCCGGAGCCGGCGCCGGCGCCACTTGTACTCTTTCCGACAATCAAGTGATTCTAGCTTCCAACAGCCCCAAGAAGCCGGCCGGGCGGAAGAAGTTCCGGGAGACGCGCCACGCGGTGTACCGTGGCATCCGGTGGCGGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774431.1
MDMFGSSNSDQYPGVQDVWSPSSSSEAAAEPAVSSSHIGSSGAGAGATCTLSDNQVILASNSPKKPAGRKKFRETRHAVYRGIRWRNSGKWVCEIREPNNKSRIWLGTFATAEMAARAYDVAAIALRGRSAVLNFADSTWRLPTPASSSRQDIQRAAAEAAEAFRPQSADERGPEAADANAASTETCSFMDEEALFGMHGWFLSDMAEGLMLPPPPLYNHDVEMEAVDMPLWNF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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