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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002462`

染色体: Chr07 坐标: 23160468-23163089 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002462`
名称	SmilChr07G002462
描述	uncharacterized SmilChr07G002462
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	23160468 - 23163089 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993540`
GeneID	`130993540`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993540`
原始查询	`LOC130993540`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LOW protein: M-phase inducer phosphatase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836338]; symbol=TRM25; hit=AT5G62170; species=arabidopsis; confidence=low
产物	LOW protein: M-phase inducer phosphatase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836338]; symbol=TRM25; hit=AT5G62170; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G62170` (TRM25) LOW protein: M-phase inducer phosphatase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836338] identity=34.3; qcov=1.14; evalue=7.29e-78; confidence=low
Rice	`Os04g0106500` - identity=27.7; qcov=0.307; evalue=1.53e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14309 (DUF4378); PF14383 (VARLMGL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993540

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057774448.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057774448.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057774448.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774448.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774448.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:23160997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,D10
`Chr7:23161131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C57,C86
`Chr7:23161280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,A9,B69,C4
`Chr7:23161284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C35
`Chr7:23161386`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr7:23161575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,C5,D3
`Chr7:23161589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B19,D10
`Chr7:23161614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B44,C71,D7
`Chr7:23161666`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B75
`Chr7:23161666`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B75
`Chr7:23161676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr7:23161691`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B105,B123,B2,B75,B96,C21,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774448.1

577 aa

288

577

VARLMGL

DUF4378

PF14383 VARLMGL 113-138 aa PF14309 DUF4378 403-559 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774448.1`	Pfam	`PF14383`	VARLMGL	Domain	113	138	4e-11	43.0	DUF761-associated sequence motif
`XP_057774448.1`	Pfam	`PF14309`	DUF4378	Domain	403	559	4.4e-27	96.2	LONGIFOLIA 1/2-like C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918465.1
CAGATCCCGATCTTAAATTTAAAATTATGGAGGGAGATGGCACACGCACATGACACATATACATATTCATAATCATCTCTAGCTAGAAAAATAAAGCCAAGAAAGAGAGCGTGGTCATTTCGTCATCCTTCCTGTTCCCAAGAGCAAGAAACAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGTCCCTCCTCCTTGGGAGTGAGTGACAATAATAATAAACTGTTTGATTAGCAGACGCATATTTAGATTGTAGAGTGTGAAGAAAAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993540
ATGGGCAGAGAGTGGCTATATTGGGTGGGAGTGCCCCGCCCCTCCACCAGAAGGCGGAAGCCTCACACTCAGACTCAGACCACCTCCGCCGGCTGCATGTGTGCCGTTTTTCAGCTCTTCGATTTGCATCACCACCTTCCTCTCAATCACCAACATTCTCTCGCCCCTTTCATTCAGCAACAATCCATCTCTCACCATGCAGCCGTGGACGCACCAAGAAACAGCTTGGAACTGGAGGAGCCACCCGCCGCCATTCAACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774448.1
MGREWLYWVGVPRPSTRRRKPHTQTQTTSAGCMCAVFQLFDLHHHLPLNHQHSLAPFIQQQSISHHAAVDAPRNSLELEEPPAAIQQEENLNFPGGIQIKTRRKDDSGAESSMDSPSTKTPNLVARLMGLDLLPESSSPSFSSTKSKDRNRCFYDDDIKVGARSLPETPKIDYHRLSLQINKENHTNDTRPRFRQQQDENSYAKQILKQVKQTVSTRVGLDITNTTRDEIRRDQNLLIKLSKKNDTKQSTTSPKLRILDT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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