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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002470`

染色体: Chr07 坐标: 23224547-23226615 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002470`
名称	SmilChr07G002470
描述	mitochondrial metalloendopeptidase OMA1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	23224547 - 23226615 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993548`
GeneID	`130993548`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993548`
原始查询	`LOC130993548`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial metalloendopeptidase OMA1
产物	mitochondrial metalloendopeptidase OMA1
Arabidopsis	`AT5G51740` (AT5G51740) Peptidase family M48 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835248] identity=55.3; qcov=1.05; evalue=3.05e-171; confidence=high
Rice	`Os02g0735100` - identity=53.8; qcov=0.845; evalue=1.56e-138; confidence=high
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0016020 (membrane); GO:0051603 (GO:0051603)
KEGG	-
Pfam	PF01435 (Peptidase_M48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993548

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057774460.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057774460.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.80000	`XP_057774460.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774460.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774460.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:23224784`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr7:23224868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr7:23226158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B71,B89
`Chr7:23226217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B34,B45,C37,C44
`Chr7:23226264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr7:23226385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B51,B85,B91
`Chr7:23226402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774460.1

433 aa

216

433

Peptidase_M48

PF01435 Peptidase_M48 249-409 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774460.1`	Pfam	`PF01435`	Peptidase_M48	Domain	249	409	2.2e-32	113.1	Peptidase family M48

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918477.1
GCTGCAGGTCAAATTGACGGTCGAGGGTTCCTGTCCCACTATCGCGTTCTTTTTTCGTGAAGCCAAAGTTTCGAAACTTCCATTACCTTCTTTCCCTCTTCCATTATACATCAGAACCTGACCTCAAATTTTCTGATTTCAAGTAAATTTGAGCGATCCACGTCATGGGATGGTACCGGAGATCGTCAAGATTTCTTTTCGATGCTTTTCGTCGCTCCAATTCCAAGACTCCCGTTCAAGAATCTGTTTATCCAAATACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993548
ATGGGATGGTACCGGAGATCGTCAAGATTTCTTTTCGATGCTTTTCGTCGCTCCAATTCCAAGACTCCCGTTCAAGAATCTGTTTATCCAAATACATTTTCTTCTAGATCTGTTTCAAGCGGGTCAAGAATTTGTCAACCGTTTTTCAGGCTGCAGAATGTGGTGAAGAACAACCAACGGAAAAACCCTTTTGATGGGGCAAAGAGGTTCTATTTCGTTGACGGAGACAAAGTTCACCACTTCAAAGCCAGGGGATACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774460.1
MGWYRRSSRFLFDAFRRSNSKTPVQESVYPNTFSSRSVSSGSRICQPFFRLQNVVKNNQRKNPFDGAKRFYFVDGDKVHHFKARGYKRWSQNPKVVSSIFLVGTGVVVTVYFGNLETVPYTKRTHFVLLSSSLEKHIGETSFKSVKSEYKGKILPPLHPESIRVQKIAQDIVEAVKKGLRKEQVWTDIGYSSESAPPQEAREQEAVRAFGDEAEKWSGEDKWRKEDEMLDDGWVQQSRKKGQETGVKSQTAHLEGFKWEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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