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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002498`

染色体: Chr07 坐标: 23709151-23713434 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002498`
名称	SmilChr07G002498
描述	beta-arabinofuranosyltransferase RAY1
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	23709151 - 23713434 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993577`
GeneID	`130993577`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993577`
原始查询	`LOC130993577`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-arabinofuranosyltransferase RAY1
产物	beta-arabinofuranosyltransferase RAY1
Arabidopsis	`AT1G70630` (AT1G70630) Nucleotide-diphospho-sugar transferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843400] identity=51.7; qcov=0.97; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0513700` - identity=63.1; qcov=0.328; evalue=2.2e-105; confidence=low
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03407 (Nucleotid_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993577

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057774488.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057774488.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774488.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774488.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774488.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:23710038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C12
`Chr7:23710271`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:23710281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C50
`Chr7:23710728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B60,B79,C36
`Chr7:23710879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr7:23711231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:23711549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr7:23711585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr7:23711706`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr7:23711720`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C18
`Chr7:23711832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B78,D4
`Chr7:23712027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774488.1

711 aa

356

711

Nucleotid_trans

PF03407 Nucleotid_trans 462-682 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774488.1`	Pfam	`PF03407`	Nucleotid_trans	Family	462	682	7.2e-49	167.3	Nucleotide-diphospho-sugar transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918505.1
AAAATAAAACAATGAAGTCAAATGGAACCGAAAAGAATACAAATCCAAGCCAAATGAGACGCTGGGAGTATTAAATAACTAACAATTCAGAAACCGTTACATCAGTCTGCAAGTGCAACTTTGAGCTTTGAATTCGCAAATGCACCACTACCGAATTCATCTTTTTCCGTTTCGACTTCAACATCTGTGCAGCCAACTCGATCTCTATCAAATTTTCAAGCTTGAAACTTTTTACCAGCCCCACTTTTTGTGCCAGTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993577
ATGCTTAAAGGGGGCGCAGAAAGAAATTCTCACTTCTTCGATTCATTTATTTCAAATCAAAGGGCGGACATGGATTCCAGCTATTCACTTTTCTTATCCACTATCTATAACAAGAAGATTCTGCAAAGTGGGCTTTGGCTTGTTTGGATGTGTGGATTCTTCTTGATTGGTGTGTCCTTCTACGGCACTCAAATGCTGAAAGAACAGATCAAGATCAAAATCAAGAAACCGGGTGTTTCCGGTGTTGGCTTTGATGATTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774488.1
MLKGGAERNSHFFDSFISNQRADMDSSYSLFLSTIYNKKILQSGLWLVWMCGFFLIGVSFYGTQMLKEQIKIKIKKPGVSGVGFDDLSIPIITIFTAPRPFIGSIGERQSLAVRSWLGLSENINVVLCSQDPSVFSFAGSIGSRISVETKIDFTFMGTPFFHSMVARSLSSSSDISVLIDPDTILLADLFSTLKYAHKLDDDWLLVASSQNVSSFPFWLQSDGKSWLGGDGKRAGIQKLQAFLVQESSSRPCGEKMLIAW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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