当前解析结果
SmilChr07G002497| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002497 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002497 |
| 描述 | inorganic phosphate transporter 2-1, chloroplastic |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 23706322 - 23709184 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130993578 |
|---|---|
| GeneID | 130993578 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993578 |
| 原始查询 | LOC130993578 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | inorganic phosphate transporter 2-1, chloroplastic |
| 产物 | inorganic phosphate transporter 2-1%2C chloroplastic |
| Arabidopsis | AT3G26570 (PHT2;1)phosphate transporter 2;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822265] identity=70.5; qcov=1.08; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os02g0593500 (OsPT14)- identity=70.2; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0005315 (phosphate transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0035435 (phosphate ion transmembrane transport) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01384 (PHO4) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993578 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057774489.1 |
| 2 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 1.00000 | XP_057774489.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057774489.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057774489.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057774489.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:23706552 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:23706657 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:23706883 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A5 |
Chr7:23706972 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B14,C77,D11 |
Chr7:23706992 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B80 |
Chr7:23707026 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B26 |
Chr7:23707080 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B9,C35 |
Chr7:23707114 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B78 |
Chr7:23707137 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B9,C35 |
Chr7:23708172 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C48 |
Chr7:23708304 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B9,C35 |
Chr7:23708430 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D2 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057774489.1PF01384
PHO4 139-537 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057774489.1 |
Pfam | PF01384 |
PHO4 | Family | 139 | 537 | 1.1e-108 | 364.2 | Phosphate transporter family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。