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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002519`

染色体: Chr07 坐标: 23860879-23863098 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002519`
名称	SmilChr07G002519
描述	uncharacterized SmilChr07G002519
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	23860879 - 23863098 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993594`
GeneID	`130993594`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993594`
原始查询	`LOC130993594`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dicer-like protein (DUF936) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838990]; symbol=AT1G23790; hit=AT1G23790; species=arabidopsis; confidence=high
产物	dicer-like protein (DUF936) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838990]; symbol=AT1G23790; hit=AT1G23790; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G23790` (AT1G23790) dicer-like protein (DUF936) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838990] identity=56.8; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0108800` - identity=52.2; qcov=0.48; evalue=2.82e-70; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06075 (CORD_N); PF21647 (CORD_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993594

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774511.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057774511.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.60000	`XP_057774511.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774511.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774511.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:23861007`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	83	A1,A13,A2,A22,A6,A7,A8,B101,B114,B119,B121,B129,B131,B134,B135,B137,B140,B19,B23,B26,B27,B29,B34,B35,B38,B39,B47,B48,B5,B52,B54,B57,B61,B63,B64,B65,B73,B76,B78,B79,B8,B82,B83,B86,B88,B89,B90,B91,B92,C12,C17,C18,C26,C29,C3,C30,C31,C36,C38,C39,C41,C44,C45,C50,C51,C52,C53,C55,C56,C65,C70,C72,C75,C78,C80,C84,C86,C87,C9,D1,D11,D4,D5
`Chr7:23861050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr7:23861151`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B10,C82
`Chr7:23861151`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B10,C82
`Chr7:23861249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B33,C53
`Chr7:23861257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C35
`Chr7:23861331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C51
`Chr7:23861915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:23861927`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C6,C82
`Chr7:23862059`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B18,B45,C19
`Chr7:23862142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C83
`Chr7:23862145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B73,C11,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774511.1

527 aa

264

527

CORD_N

CORD_C

PF06075 CORD_N 4-120 aa PF21647 CORD_C 288-382 aa PF21647 CORD_C 395-485 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774511.1`	Pfam	`PF06075`	CORD_N	Domain	4	120	1.1e-45	155.0	CORD, N-terminal domain
`XP_057774511.1`	Pfam	`PF21647`	CORD_C	Domain	288	382	6.2e-28	99.1	CORD, C-terminal domain
`XP_057774511.1`	Pfam	`PF21647`	CORD_C	Domain	395	485	6.2e-28	99.1	CORD, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918528.1
ATTTATACATTAAAAAATACTACTATATGACTTACTACTTTGTAGCAGTAAGGGCATCTAGTCTAGGACGTGAGCAGCAGAGGAGAGCAGACCCACCAACGCGAAACATGACCGTTATACTCCTCCGCAACGTTCCAAATTCCCAGATTTTAAATTCTTCATTTGCTGCCGACCGTTGAGCCTCACCTCACCTCTCATCACCACCGCTCCCCATTTACTTCACTCACGCAATCCACCTCCACAGCTAAAACAAAAGGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993594
ATGGCGGCCTTGGCACCGGGGATTCTGTTGAAGCTCTTGGACGGGATGAACACGGGGCTGAAGCCGACGAGCGAGCACCGGAGCTCGCTCGTGCAGGTCACCGACATCGTCCCGGCGGATCTCGACGAGAAGAACCTGCTTCCGAAGCACGGCTTCTACATCAAGGTCTCTGACTCCTCGCATTCCATCTACGTCAGCCTTCCCTTCGACCAAGACGATCTCGTCATGAGCAACAAGATGCAGTTGGGCCAGTTCATCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774511.1
MAALAPGILLKLLDGMNTGLKPTSEHRSSLVQVTDIVPADLDEKNLLPKHGFYIKVSDSSHSIYVSLPFDQDDLVMSNKMQLGQFIYVDRLDPGSPVPVVRGAKPLPGRHPLVGTPEPLMGLRAKGERTAAKFSAPKRASWDTGSDAVESPRILKPVPLDFDQCTPVKERPPSAVKFSGNFQMSPAIRGRAMRDGSAVRSSAGGALLSKMMETPMMRKSCVITPSVSRSRSVCDRKQRISKSPFNLAEKRSSTPPPSFAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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