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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002518`

染色体: Chr07 坐标: 23860013-23860782 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002518`
名称	SmilChr07G002518
描述	uncharacterized SmilChr07G002518
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	23860013 - 23860782 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993595`
GeneID	`130993595`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993595`
原始查询	`LOC130993595`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768848]; symbol=AT3G12345; hit=AT3G12345; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768848]; symbol=AT3G12345; hit=AT3G12345; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G12345` (AT3G12345) FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768848] identity=62.5; qcov=0.774; evalue=6.62e-49; confidence=medium
Rice	`Os06g0484500` - identity=42.7; qcov=0.957; evalue=1.15e-28; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF31213 (HliA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993595

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057774512.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057774512.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057774512.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774512.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774512.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:23860744`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	93	A13,A20,A21,A22,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B10,B100,B104,B106,B107,B111,B115,B118,B119,B12,B124,B126,B129,B13,B130,B132,B138,B14,B140,B19,B20,B24,B25,B30,B31,B34,B35,B39,B45,B46,B5,B60,B62,B64,B65,B67,B7,B77,B82,B84,B9,B90,B92,B93,B98,B99,C11,C13,C15,C19,C2,C21,C29,C31,C35,C36,C37,C39,C4,C43,C44,C45,C46,C47,C49,C5,C53,C54,C56,C6,C63,C64,C66,C69,C75,C79,C82,C83,C84,D10,D3,D5,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774512.1

186 aa

186

HliA

PF31213 HliA 107-145 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774512.1`	Pfam	`PF31213`	HliA	Family	107	145	1e-10	42.1	High light-inducible protein HliA

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918529.1
AAATTGGGATCGAATTTTTAATTTAAGAAACAACTGAGGCGATTAAGGAAATATACAATATTACGGGGACGGCTGCGATATTTACCACAAAATGTTGGTATCCCCTCAGGCCTCAGCCTCAGAAAAACAAATCCAAACTTAAAAAAGAAAAGAAAGGGCGAGAAGCAGAATAAGAAATCAAGCAGCAATGGCGACTCTACCACCTTCAACTCTCCAAACAATAACATTCCCATCTTCACCACGACCGCACCATCCACTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993595
ATGGCGACTCTACCACCTTCAACTCTCCAAACAATAACATTCCCATCTTCACCACGACCGCACCATCCACTCAAACTCGCCGCGCCTCCCCGCGCCGCCCCAGAAGAACCCTCCTCATCCGAGCCCGCCTCCTCTGAGCAGGAGGACAGCTTCGAGAACCGCCTCTCGCAAGTCCGCCTCCGGTACCGCAGCGGATCCGGCAAGAAGGCGGAGGTGCGGAAGAGCCGGAAGGGGAAGAAGACCGGGTCGGGATCCGGTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774512.1
MATLPPSTLQTITFPSSPRPHHPLKLAAPPRAAPEEPSSSEPASSEQEDSFENRLSQVRLRYRSGSGKKAEVRKSRKGKKTGSGSGSGSSVFLPPVALKEPKSEGLNVEFGFSPYSERVNGRIAILGLTALFLVELATGQGVINYHTPSIIFIQVYFVAAVSAIYVKYEKEKTSVWPQSDDAFFED

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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