当前解析结果
SmilChr07G002526| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002526 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002526 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr07G002526 |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 23930259 - 23931382 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993603 |
|---|---|
| GeneID | 130993603 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993603 |
| 原始查询 | LOC130993603 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007676]; symbol=AT1G10657; hit=AT1G10657; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007676]; symbol=AT1G10657; hit=AT1G10657; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT1G10657 (AT1G10657)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007676] identity=67; qcov=0.822; evalue=3.69e-41; confidence=medium |
| Rice | Os05g0462000- identity=47.4; qcov=0.71; evalue=1.55e-23; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF09713 (A_thal_3526) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993603 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057774522.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057774522.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057774522.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057774522.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057774522.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:23930517 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 6 | A20,B118,C11,C54,C69,C75 |
Chr7:23930734 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B114,B60 |
Chr7:23930902 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B76,B88,C60 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057774522.1PF09713
A_thal_3526 24-74 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057774522.1 |
Pfam | PF09713 |
A_thal_3526 | Domain | 24 | 74 | 2.6e-24 | 86.0 | Plant protein 1589 of unknown function (A_thal_3526) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。