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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002555`

染色体: Chr07 坐标: 24273624-24278960 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002555`
名称	SmilChr07G002555
描述	protein NSP-INTERACTING KINASE 3
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	24273624 - 24278960 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993627`
GeneID	`130993627`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993627`
原始查询	`LOC130993627`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein NSP-INTERACTING KINASE 3
产物	protein NSP-INTERACTING KINASE 3
Arabidopsis	`AT1G60800` (NIK3) NSP-interacting kinase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842374] identity=72.9; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0171000` (OsSERL5) - identity=73.3; qcov=0.978; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2); PF12799 (LRR_4); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993627

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057774568.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774568.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774568.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057774568.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057774568.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:24274575`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr7:24275902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B33,C2,C39
`Chr7:24276086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B115,B136,B55
`Chr7:24276101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr7:24276461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,D10
`Chr7:24276612`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,D6
`Chr7:24277659`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B76,B88,C19,C60
`Chr7:24277734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr7:24277899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr7:24278048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr7:24278060`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B92
`Chr7:24278060`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774568.1

625 aa

312

625

LRRNT_2

LRR_4

LRR_8

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF08263 LRRNT_2 32-70 aa PF12799 LRR_4 98-135 aa PF13855 LRR_8 98-158 aa PF00560 LRR_1 99-121 aa PF00560 LRR_1 123-145 aa PF00560 LRR_1 147-167 aa PF00069 Pkinase 303-573 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 304-575 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774568.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	32	70	6.2e-13	49.5	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057774568.1`	Pfam	`PF12799`	LRR_4	Repeat	98	135	4.7e-10	40.1	Leucine Rich repeats (2 copies)
`XP_057774568.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	98	158	8.3e-11	42.2	Leucine rich repeat
`XP_057774568.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	99	121	4.1e-13	47.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057774568.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	123	145	4.1e-13	47.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057774568.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	147	167	4.1e-13	47.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057774568.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	303	573	3.1e-43	148.8	Protein kinase domain
`XP_057774568.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	304	575	1e-42	147.0	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918585.1
AAAAAAAAAAGAGTCCATAAACCAACAAAGACTGGACAAGCCAAGCACGTGACCTGCCAAAAAAATTTCTTTATTTTTTTGCTTTTTGATTTGCTTTTTGGACCTAAAGACATACCATTGTTCTCTCTGAATCAATCACACGCACATCCCTTCAGTCCAAATCACTGAATATAAAGCAAATTTTTTGCTTCCCCAAAAAATACAACTAGCTTTTCACATTAAATACATTTAAAAAAATTAAATATTGTACATAAAATGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993627
ATGGAAAGAGGAAAATTCCTGCTCTGGCAAGTGGGATTGCTGGTTTTGGCAATAATTGAGGCTTCTCATTCAACTCTATCTCCTTCTGGTGTAAATTATGAAGTTGTTGCTTTAATCGCGATAAAGAATGACTTACACGATCCTTACAATGTGCTGGAGAATTGGGATGCTAATTCTGTTGATCCTTGTAGTTGGAGAATGGTTACTTGTGCCCAAGATGGTTATGTCTCTGCTCTAGGACTACCTAGCCTTAGCTTGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774568.1
MERGKFLLWQVGLLVLAIIEASHSTLSPSGVNYEVVALIAIKNDLHDPYNVLENWDANSVDPCSWRMVTCAQDGYVSALGLPSLSLSGTLSPGIANLTNLQSVLLQNNGITGTIPAVIGKLEKLQTLDLSNNKLTGEIPISLGDLKNLNYLRLNNNSLTGPIPDSLTKVESLTLVDLSFNNFSGSLPKIPARTFKIVGNPLICGQTSQNNCSVVYPEPLSFPPDAAKDQPDSGAKHHVAVAFGASFGGAFSIIVVVGLIF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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