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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002572`

染色体: Chr07 坐标: 24553173-24559396 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002572`
名称	SmilChr07G002572
描述	uncharacterized SmilChr07G002572
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	24553173 - 24559396 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993640`
GeneID	`130993640`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993640`
原始查询	`LOC130993640`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	HD domain-containing metal-dependent phosphohydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834025]; symbol=AT5G40270; hit=AT5G40270; species=arabidopsis; confidence=high
产物	HD domain-containing metal-dependent phosphohydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834025]; symbol=AT5G40270; hit=AT5G40270; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G40270` (AT5G40270) HD domain-containing metal-dependent phosphohydrolase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834025] identity=67.9; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0109300` - identity=65; qcov=0.976; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006203 (dGTP catabolic process); GO:0008832 (dGTPase activity)
KEGG	smil03250 (Viral life cycle - HIV-1 - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01966 (HD); PF19276 (HD_assoc_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993640

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057774592.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057774592.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057774592.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057774593.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774592.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:24553408`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C74,C79
`Chr7:24553408`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C74,C79
`Chr7:24553412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B5,B62,C61
`Chr7:24553432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,C42
`Chr7:24555406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr7:24555429`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C22
`Chr7:24555429`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C22
`Chr7:24555594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr7:24556582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr7:24558857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,C28,C79
`Chr7:24558898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:24559033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774592.1

477 aa

238

477

HD_assoc_2

PF01966 HD 74-166 aa PF19276 HD_assoc_2 226-336 aa

XP_057774593.1

413 aa

206

413

HD_assoc_2

PF01966 HD 10-102 aa PF19276 HD_assoc_2 162-272 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774592.1`	Pfam	`PF01966`	HD	Family	74	166	1.5e-10	42.1	HD domain
`XP_057774592.1`	Pfam	`PF19276`	HD_assoc_2	Family	226	336	1.1e-05	25.7	HD associated region
`XP_057774593.1`	Pfam	`PF01966`	HD	Family	10	102	1.1e-10	42.5	HD domain
`XP_057774593.1`	Pfam	`PF19276`	HD_assoc_2	Family	162	272	8e-06	26.2	HD associated region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918609.1
TTGGCGGCATCACTACATCCCCTTCACCACCACGATCGAAGCACCACTCCAAATTCTCATATTCCACCATAAATACTCCTTCCCCCTCATACTTTCAATATACTTTTCTCTCTCTACAACTTCGAATTTCCTCTCCCAAGCTCTGTTCTATTCGCCGCAGAAATCGAAAATTCCTGCAAGAGAGGATGGGAGCTAACTACCTCAATGATGCCACGAGCTACGGCGCCGCGCTTTCTTCCGGCGACGAGAGAAGCTTCTCG...

XM_057918610.1
GAAACATCTATCTCGATCCTCTCTCTTTGAAGTTTATCGACACAGAACAATTTCAGAGATTCGATCTCAAGTCATTATTGACTGAATTCCTTATTGTGATGCAGACTTCGTGATTTGAAGCAGCTAGGAGTGTCATACATGGTCTACCCTGGGGCTGTACATTCTCGCTTTGAGCATTCACTTGGGGTATATTGGCTGGCTAGTGAAGCTATCAACAGATTGAAGACCTATCAAGGCTTGGAGCTTGACATTGATCGTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130993640
ATGGGAGCTAACTACCTCAATGATGCCACGAGCTACGGCGCCGCGCTTTCTTCCGGCGACGAGAGAAGCTTCTCGAAGCACGTCCACGATAACGTTCACGGAAACATCTATCTCGATCCTCTCTCTTTGAAGTTTATCGACACAGAACAATTTCAGAGACTTCGTGATTTGAAGCAGCTAGGAGTGTCATACATGGTCTACCCTGGGGCTGTACATTCTCGCTTTGAGCATTCACTTGGGGTATATTGGCTGGCTAGTGA...

LOC130993640
ATGGTCTACCCTGGGGCTGTACATTCTCGCTTTGAGCATTCACTTGGGGTATATTGGCTGGCTAGTGAAGCTATCAACAGATTGAAGACCTATCAAGGCTTGGAGCTTGACATTGATCGTTTTGACACACAAACTGTGAAGATTGCTGGTCTACTACATGATCTGGGTCATGGACCGTTCAGCCACATGTTTGAGCGTGAATTTATTCCACGGGTTCGCCATGGCCTGAAATGGTCTCATGAAGAAATGTCTCTGAAGAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057774592.1
MGANYLNDATSYGAALSSGDERSFSKHVHDNVHGNIYLDPLSLKFIDTEQFQRLRDLKQLGVSYMVYPGAVHSRFEHSLGVYWLASEAINRLKTYQGLELDIDRFDTQTVKIAGLLHDLGHGPFSHMFEREFIPRVRHGLKWSHEEMSLKMIDYIVDEHNIDTDSEMLKKVKEMIIASEKDAVNSSKEKKFLYEIVANGRNGIDVDKFDYIVRDSRACGLGCNFEYQRVLETMRVINDEICHRAKEYLTIHKLFAARADL...

XP_057774593.1
MVYPGAVHSRFEHSLGVYWLASEAINRLKTYQGLELDIDRFDTQTVKIAGLLHDLGHGPFSHMFEREFIPRVRHGLKWSHEEMSLKMIDYIVDEHNIDTDSEMLKKVKEMIIASEKDAVNSSKEKKFLYEIVANGRNGIDVDKFDYIVRDSRACGLGCNFEYQRVLETMRVINDEICHRAKEYLTIHKLFAARADLHRTVYMHAKVKAIELMLVDAMTKANDVLQISSYIDEPAQYWKLDDTIVKTIETSTSQDLKESRD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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