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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002621`

染色体: Chr07 坐标: 25278925-25282992 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002621`
名称	SmilChr07G002621
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 22
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	25278925 - 25282992 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993681`
GeneID	`130993681`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993681`
原始查询	`LOC130993681`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 22
产物	DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 22
Arabidopsis	`AT1G59990` (EMB3108) DEA(D/H)-box RNA helicase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842293] identity=55.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0383400` (OsRH22) - identity=59; qcov=0.757; evalue=5.79e-174; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003724 (RNA helicase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0009507 (chloroplast)
KEGG	-
Pfam	PF00270 (DEAD); PF00271 (Helicase_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993681

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057774668.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057774668.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.20000	`XP_057774668.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774668.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774668.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:25279156`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,B44
`Chr7:25280391`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr7:25280655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr7:25280675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr7:25280743`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr7:25280820`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A18,A2,A5,B10,B107,B109,B129,B133,B16,B27,B42,B44,B65,B71,B8,C19,C23,C3,C42,C58,C62,C82,D11,D7
`Chr7:25280871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr7:25280881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C14
`Chr7:25281381`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B44,D11,D7
`Chr7:25281383`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr7:25281579`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B136,B99,D4
`Chr7:25281592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774668.1

576 aa

288

576

DEAD

Helicase_C

PF00270 DEAD 106-267 aa PF00271 Helicase_C 421-512 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774668.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	106	267	7.1e-25	88.4	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057774668.1`	Pfam	`PF00271`	Helicase_C	Domain	421	512	3.9e-20	72.9	Helicase conserved C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918685.1
TCAACCCTTCCGAAAATAAACAGAAAAAGTGAAAAATATAAAAGAGCAAAACCCAAAGCAAAACCCGTCATCCATTCCTACAGCGGAGAAAATGCGTCTGCAGCGTTCAATTTCAGTGCTTAATTCTTGCAGAACTTCATTACATTCGACGAGGATTATCTCAATTTCTGCGAGCAACCTCTCTTTACTATCACCCTCACCGGCGTATTTTTCCAGTCTCAGCAGTTATCGCCAGCTCAAGGCCCATAAACTCCGAGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993681
ATGCGTCTGCAGCGTTCAATTTCAGTGCTTAATTCTTGCAGAACTTCATTACATTCGACGAGGATTATCTCAATTTCTGCGAGCAACCTCTCTTTACTATCACCCTCACCGGCGTATTTTTCCAGTCTCAGCAGTTATCGCCAGCTCAAGGCCCATAAACTCCGAGCCTTCGCCACAAACGCAGCCGCCGCCGCCGCCGACGACGAGAACGCCGACACGTTTTTGGCGGAGGAAAGCGTTTCCTGGGCTTCTCTTGGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774668.1
MRLQRSISVLNSCRTSLHSTRIISISASNLSLLSPSPAYFSSLSSYRQLKAHKLRAFATNAAAAAADDENADTFLAEESVSWASLGVSDSISRALCNAGLPRPSLVQAACVPAILSGADVVVAAETGSGKTHGYLVPIIHKVCSNLDALHDPKPKKCQHVSLVLCPNVMLCEQVVRMANSLLDGAGEPLLKAAAICGRQGLSVKDPDIIVSTPVALLNYLYAIDPEKRKCTDFIRGVKYVVFDEADLLLCGSFQNQVIRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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