当前解析结果
SmilChr07G002619| 统一新 Gene ID | SmilChr07G002619 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr07G002619 |
| 描述 | protein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2, chloroplastic |
| 染色体 / SeqID | Chr07 / NC_080393.1 |
| 坐标与链方向 | 25272812 - 25274060 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130993688 |
|---|---|
| GeneID | 130993688 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130993688 |
| 原始查询 | LOC130993688 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2, chloroplastic |
| 产物 | protein PLASTID REDOX INSENSITIVE 2%2C chloroplastic |
| Arabidopsis | AT1G10522 (PRIN2)Serine/Threonine-kinase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837593] identity=72.1; qcov=0.726; evalue=8.76e-66; confidence=high |
| Rice | Os09g0382400 (PRIN2)- identity=56.9; qcov=0.732; evalue=9.14e-37; confidence=medium |
| GO | GO:0010468 (regulation of gene expression) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130993688 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057774696.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.80000 | XP_057774696.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057774696.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057774696.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057774696.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr7:25273077 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B71 |
Chr7:25273092 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,D11 |
Chr7:25273865 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B130,B136,B99,C49 |
Chr7:25273878 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A21,B124,B20 |
Chr7:25273892 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
Chr7:25273933 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B132,B5,B62,C79 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。