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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr07G002625`

染色体: Chr07 坐标: 25319511-25321441 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr07G002625`
名称	SmilChr07G002625
描述	40S ribosomal protein S6
染色体 / SeqID	Chr07 / NC_080393.1
坐标与链方向	25319511 - 25321441 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130993691`
GeneID	`130993691`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130993691`
原始查询	`LOC130993691`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S6
产物	40S ribosomal protein S6
Arabidopsis	`AT5G10360` (EMB3010) Ribosomal protein S6e [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830900] identity=90; qcov=1; evalue=4.61e-164; confidence=high
Rice	`Os03g0390000` (RPS6) - identity=92.2; qcov=0.976; evalue=6.67e-166; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01092 (Ribosomal_S6e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130993691

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057774698.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057774698.1`
3	Nucleolus	核仁	0.20000	`XP_057774698.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057774698.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057774698.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr7:25319725`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C46,D11
`Chr7:25319789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B104,C13,C33,D3
`Chr7:25319880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr7:25320142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr7:25320148`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr7:25320279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr7:25320419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B136,B99,D4
`Chr7:25320460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057774698.1

249 aa

124

249

Ribosomal_S6e

PF01092 Ribosomal_S6e 1-128 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057774698.1`	Pfam	`PF01092`	Ribosomal_S6e	Family	1	128	1.6e-52	177.3	Ribosomal protein S6e

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057918715.1
GGAAGAGAGGCCATCATTTTAGAAGATGGGCCATAACTTCTTGGGCCAATTATCATTATTTATGAAGGTCCCATAAACCACCTTCGAAACCCTAGCTCGGGAAGAGAGGGAGTGTTTCTCACATCGCCAAACTGGGAGAAGAGAGGCCGGCATTTTAGAGTGTTTCTCACATCGCCATCTTCAATGAAGTTCAACATAGCCAATCCGACCACTGGTTGCCAGAAGAAGTTGGAAATTGACGATGACCTAAAACTCCGTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130993691
ATGAAGTTCAACATAGCCAATCCGACCACTGGTTGCCAGAAGAAGTTGGAAATTGACGATGACCTAAAACTCCGTGTTTTCTGGGACAAGAGGATCTCTCAGGAAGTCAGTGGAGATGCACTTGGAGATGAGTTCAAAGGGTATGTTTTCAAGATTATGGGTGGCTGTGACAAGCAGGGCTTCCCAATGAAGCAGGGTGTCTTGACACCTGGTCGTGTGAGACTCCTGCTGCACCGCGGTACCCCGTGCTTTCGTGGTTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057774698.1
MKFNIANPTTGCQKKLEIDDDLKLRVFWDKRISQEVSGDALGDEFKGYVFKIMGGCDKQGFPMKQGVLTPGRVRLLLHRGTPCFRGYGRRNGERRRKSVRGCIVSPDLSVLNLVIVKKGDNDLPGLTDTEKPRMRGPKRASKIRKLFNLNKEDDVRKYVNTYRRTFTTKSGKKVSKAPKIQRLVTPLTLQRKRGRIAEKKKRIAKAKSEAADYQKLLAQRLKEQRERRSESLAKKRSRLSAASKPSIAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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